Basic Information
Symbol
F12
RNA Class
mRNA
Alias
coagulation factor XII
Plasma coagulation Factor XIIa
coagulation factor XII (Hageman factor)
HAE3
HAEX
HAF
Hageman factor
beta-factor XIIa part 1
beta-factor XIIa part 2
coagulation factor XIIa heavy chain
coagulation factor XIIa light chain
Coagulation factor XII
EC 3.4.21.38
EC 3.4.21
Location (GRCh38)
5:177402133-177416583
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_000505.4
Sequence length
2036 nt
GC Content
0.6498
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-890.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-923.2 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
636.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_000505.4 | ACUCCUGGAUAGGCAGCUGGACCAACGGACGGAUGCCAUGAGGGCUCUG… | 2036 nt | 0.6498 |
Summary
This gene encodes coagulation factor XII which circulates in blood as a zymogen. This single chain zymogen is converted to a two-chain serine protease with an heavy chain (alpha-factor XIIa) and a light chain. The heavy chain contains two fibronectin-type domains, two epidermal growth factor (EGF)-like domains, a kringle domain and a proline-rich domain, whereas the light chain contains only a catalytic domain. On activation, further cleavages takes place in the heavy chain, resulting in the production of beta-factor XIIa light chain and the alpha-factor XIIa light chain becomes beta-factor XIIa heavy chain. Prekallikrein is cleaved by factor XII to form kallikrein, which then cleaves factor XII first to alpha-factor XIIa and then to beta-factor XIIa. The active factor XIIa participates in the initiation of blood coagulation, fibrinolysis, and the generation of bradykinin and angiotensin. It activates coagulation factors VII and XI. Defects in this gene do not cause any clinical symptoms and the sole effect is that whole-blood clotting time is prolonged. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
