Basic Information
Symbol
F2
RNA Class
mRNA
Alias
coagulation factor II, thrombin
prepro-coagulation factor II
coagulation factor II (thrombin)
PT
RPRGL2
THPH1
prothrombin
prothrombin B-chain
thrombin factor II
Prothrombin
Coagulation factor II
EC 3.4.21.5
EC 3.4.21
Location (GRCh38)
11:46719166-46739822
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_000506.5
Sequence length
1990 nt
GC Content
0.5829
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-804.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-839.05 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
601.63
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_000506.5 | AGUGACCCAGGAGCUGACACACUAUGGCGCACGUCCGAGGCUUGCAGCU… | 1990 nt | 0.5829 |
| NM_001311257.2 | AGUGACCCAGGAGCUGACACACUAUGGCGCACGUCCGAGGCUUGCAGCU… | 1942 nt | 0.5808 |
Summary
This gene encodes the prothrombin protein (also known as coagulation factor II). This protein is proteolytically cleaved in multiple steps to form the activated serine protease thrombin. The activated thrombin enzyme plays an important role in thrombosis and hemostasis by converting fibrinogen to fibrin during blood clot formation, by stimulating platelet aggregation, and by activating additional coagulation factors. Thrombin also plays a role in cell proliferation, tissue repair, and angiogenesis as well as maintaining vascular integrity during development and postnatal life. Peptides derived from the C-terminus of this protein have antimicrobial activity against E. coli and P. aeruginosa. Mutations in this gene lead to various forms of thrombosis and dysprothrombinemia. Rapid increases in cytokine levels following coronavirus infections can dysregulate the coagulation cascade and produce thrombosis, compromised blood supply, and organ failure. [provided by RefSeq, May 2020]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
