Basic Information

Symbol
FAF1
RNA Class
mRNA
Alias
Fas associated factor 1 CGI-03 hFAF1 HFAF1s UBXD12 UBXN3A TNFRSF6-associated factor 1 UBX domain protein 3A Fas (TNFRSF6) associated factor 1 FAS-associated factor 1 UBX domain-containing protein 12 UBX domain-containing protein 3A
Location (GRCh38)
1:50437028-50960279 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_007051.3
BLAST PRIMER
NM_131917.1
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_007051.3
Sequence length
6821 nt
GC Content
0.4535

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2225.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2345.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1955.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_007051.3 AACCAGGGGCGGAGGCGGCGGCCAGGGAGGAAGCGGAGGAGGCGGAGGC… 6821 nt 0.4535
NM_131917.1 CAGGGGCGGAGGCGGCGGCCAGGGAGGAAGCGGAGGAGGCGGAGGCGGC… 2154 nt 0.5125
Summary

Interaction of Fas ligand (TNFSF6) with the FAS antigen (TNFRSF6) mediates programmed cell death, also called apoptosis, in a number of organ systems. The protein encoded by this gene binds to FAS antigen and can initiate apoptosis or enhance apoptosis initiated through FAS antigen. Initiation of apoptosis by the protein encoded by this gene requires a ubiquitin-like domain but not the FAS-binding domain. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image