Basic Information

Symbol
FAM114A2
RNA Class
mRNA
Alias
family with sequence similarity 114 member A2 133K02 chromosome 5 open reading frame 3 family with sequence similarity 114, member A2 C5orf3 protein FAM114A2 testis tissue sperm-binding protein Li 81P Protein FAM114A2
Location (GRCh38)
5:153990148-154038936 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001317993.2
BLAST PRIMER
NM_001317994.2
BLAST PRIMER
NM_001317995.2
BLAST PRIMER
NM_018691.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_018691.4
Sequence length
4414 nt
GC Content
0.3763

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1135.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1221.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1335.5
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001317993.2 AGUAGGAACGCCGAGUCGGCUGCCGUGGCUGUGCUGAGGGUGGCGGCCG… 4461 nt 0.3779
NM_001317994.2 AGUAGGAACGCCGAGUCGGCUGCCGUGGCUGUGCUGAGGGUGGCGGCCG… 4978 nt 0.3949
NM_001317995.2 AGUAGGAACGCCGAGUCGGCUGCCGUGGCUGUGCUGAGGGUGGCGGCCG… 4204 nt 0.3708
NM_018691.4 AGUAGGAACGCCGAGUCGGCUGCCGUGGCUGUGCUGAGGGUGGCGGCCG… 4414 nt 0.3763
Summary

No summary available.

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image