Basic Information

Symbol
FAM83D
RNA Class
mRNA
Alias
family with sequence similarity 83 member D dJ616B8.3 CHICA chromosome 20 open reading frame 129 family with sequence similarity 83, member D C20orf129 protein FAM83D spindle protein CHICA Protein FAM83D Spindle protein CHICA
Location (GRCh38)
20:38926312-38953106 UCSC Genome Browser

Secondary Structure

MANE Select
NM_030919.3
Sequence length
2370 nt
GC Content
0.5076

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-794.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -840.78 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 527.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(((((((((.((((((..((((((((..((..(((((.(((..(((((((..(.((((((((.(((.(((((((((((((((((((...((.(((.((((.(((...((((((.......))))))..))).))))))))).))))))))).....(((((.(((((((.((((((.((((((.....)))))).))....(((.......)))((.(((......))).)).)))).))))))).)).)))...))))))))))))))))))))).).....)))))))((((((..(..(((((((((...(((.........))).)))))))))..)..))))))...))).)))))))..))).((((.((((((..((((((((((......))))))..((((......)))).......(((....))).)))).))))))))))...((.(((((((..((.((((((((((((......))).))))).))))))..))))))).)))))))..))))))...))).)))))))))))(((((((((((.......))))))(((((((((((..(((.(((..((..((((((((((((((((((((((..((((((((...((((.((((.((((((...(((((((....))))........)))...))))))))))))))(((....)))..((((((.(((..((((((.(((((.....(((((((((............((((.((((((.(((((((.((....)).))(((.............))).))))).))..)))).))))....(((((((...........)))))))...))))).)))))))))..))))))..))).)))))).(((((((..(((...(((((.((((((.(((.(((.......)))))).....)))))).........(((.(((....((.((((...(((.(((((...)))))..))))))).))...))).)))...)))))........((....)).)))))).))))..))))))))((((.....))))..((((..(((((((((...((.(((.((((.((((.((((...((..((((....))))..))...))))))).).)))))))..))....)))..))).))))))).(((.....)))...)))))))))).))).((..((((((((.(((((.(((.........))).).))))))))((.(((.(((((.....(((....)))...))))).))))).....))))..))......)))))))))..))....))).)))........(((.((((....))))..)))..(((...))).....((((((((((...((((((.((((((((.((((((((((.((((......))))))))...((((((((((...(((.((...(((((.(((...((.(((((((............))))))).)).))))))))..))))).....((((.(((((((.......((....)).((((((.(((((((...)))))))....(((((((..((((((............(((((.........))))).........((((((..(((..(((((((.......((......))......)))))))...))).)))))).....((((((.....))))))(((((.(((.((((........))))....))).))))).))))))..)))))))...(((((......)))))..))))))((((((....(((.....)))..............))))))....................((((...))))....(((.((((...........)))).)))........(((((((........).))))))....)))))))))))...((((((......))))))))))))))))..(((..((((..(((.....)))..))))..)))...((((......))))...(((((....(((((.((..(((((...(((....)))...)))))......)))))))....))))).....)))))).....(((((((((((...(((((.........)).)))))))))))))).(((((((...)))))))...))))))))...))))))...))))))))))(((((((((((((.((((..........)))))))))..)))..)))))............))))))))))).)))))..((((((....)))))).(((((.................)))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((.(((((((..(((((((((.((((((........))))))))).}..)))))((((((((.(((.(((((((((((((((((((...((.(((.((((.(((...((((((.{....,))))))..))).))))))))).))))))))).....(((((.(((((((.((((,,,((({((,..,,||}}||.,|,,...........}))|||.{||,.....))),))})))).))))))).)),}))...)))))))))))))))))))))....)))))))..)))).))))...(((((((((...(((.........})).)))))))))(((..((((.....((((.(((.((((((((((.((((((((..,,,{((((((......))))))..((((......))))....{{{((({...)),})))).)))))))).,,..((.(((((((..((.((((((((((((......))).))))).))))))..))))))).))...|}.{(((((....}}}},,},,,,.((((((({((((((.......))))))....,(((((..{(({.(,...{((....)))}}})}}.))))),},,...})))))}),}|||{.|{{(.((((({...(((((((....}))}........)))...))))))))}))}}}{{{....}}}..{(((((.(({..((((((.((((({....{(((((((({,{....,},,,((((.((((((.((((((({((..,,||,||,......}}}...}}}),.)))))).)}.,)))).)))).,,.(((((((...........))))))).,.})))).)))))))))..))))))..}}),)))))).)))).))))))))).))))......)))).))),......((((,.{((,,((((((((({..(((..(((.(((....((.((((...(((.(((({...}))))..))))))).))...))).)))..))).,)))},......{{{((..,,,,,.))))),,.,{|{{{{({{{.,,,.))}}|.{(((((,,({(((((((.{({..({{,,(((((.(((...}))))))}....}}).))}((((((.{(((((((({,{,{{{||,((((((((.((((..{{{(.(((((({(((({{((((((((((((.((((((.(({,..((((.(((((.(((.........))).).)))))))).,,.)).)))))}...{({{(((.{((........))).))}.,,},,........,,,,(({{{,,,,,,)}}}}..,,((((((((....(((.((((....))))..)))..(((((.(((....((((((.(({.,....,.}},.......))))))..))).))))))))))))),))....))))))){.(((({...})))).}(((((.(((.,,{(.(((((((............))))))).))}))))))))..)))})}}..{(({.,....}|||....,}}},}}}))..))))..}))))))...|.....,....{((((((..((((((,,,....{{{{.(((((,,{,{(,..{((((..........))))),..,|}}|{{(((({(....}||}},.,,||....,.,,,})|{{..,,...,)))....,}}||{||}}...,))))|(((((.(((.((,(,,......))),..)}))).))))),})))))..)))))))...(((((......)))))....}}}}((((((....(((.....)))..............)))))).)))).))))))))......{|{{...))),,},.,|},}}}},}}.........)))))).........(((((((........).)))))).,.{{{|,,,.,||,,((((((((......))))))))..}}))))))))))))))..{((((((..((.{.(((.{.(((((.,.{((,..{((((.......)))))))).))))).))))).))..))))))).......,((((((.,{(.{,{,......,},)).,))}))})..,,.(((((((((((...((({{.........}).)))))))))))))).(((((({...}))))))...{{{,.,..|...,).,},}))),,}||||{{{{{,(((((((,{((((.{,.....}.)))))))))..))}..,}}}}}......,,,,....,,.||||||..,||..{(((({....}))))).}}...,,,,,,.....,,)))))))))))))..

Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_030919.3 GAGGGCUGUCGAGUCCGAGCGCCGCCAUGGCUCUGCUGUCCGAGGGCCU… 2370 nt 0.5076
Summary

Enables kinesin binding activity; microtubule binding activity; and protein kinase binding activity. Involved in several processes, including positive regulation of cell cycle G1/S phase transition; protein localization to mitotic spindle; and regulation of intracellular signal transduction. Located in cytosol; intercellular bridge; and mitotic spindle pole. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image