Basic Information

Symbol
FASLG
RNA Class
mRNA
Alias
Fas ligand FasL CD178 tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 6 Fas ligand (TNF superfamily, member 6) ALPS1B APT1LG1 APTL CD95-L CD95L TNFSF6 TNLG1A tumor necrosis factor ligand superfamily member 6 CD95 ligand apoptosis (APO-1) antigen ligand 1 apoptosis antigen ligand fas antigen ligand mutant tumor necrosis factor family member 6 tumor necrosis factor ligand 1A FASL Tumor necrosis factor ligand superfamily member 6 Apoptosis antigen ligand Fas antigen ligand CD178 antigen

Secondary Structure

MANE Select
NM_000639.3
Sequence length
1805 nt
GC Content
0.4693

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-570.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -602.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 495.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((.(((..(((((......)))))....((((((((....))).)))))....((((((....))))))((((((((((((.((..((((((((......)))))..................(((((.....))))))))..))))).))))))))).(((((......)))))(((((((((.(.((.((...(((((.((.((((.....)))).))..))))).(((((((((((((((((((((((((.((((....(((.((.(((.((.(((((...(((...(((((((.((((.((.(((((((...(((((..((((((....).)))))..)))))......))))))).))...)))).))...)))))....)))((((((((((((..((.((((((((...(((((((.(((((.(((.(((...)))))).)))))..(((((.....)))))......(((.((....(((((((((((((((((...............))).))).))...))))(((((((...(((((.(.((.......)).)..)))))...)))))))......)))))....)).)))..)))))))..))).............(((((((((((.(((.(((..(((((.(((((((((.......)))))))))..)))))..))).....(((......)))...)))..))))))).))))..))))).))..)).))))))))))...))))).)).))).)))))(((((((.(((.........(((((..((((.(((((((.(((.......))).)))).....)))))))..)))))))).))))))).((((....))))((((((.((.(((...........)))))..))))))..(((((((((((.....((((.......((((.((((((..(((((((((((..(((((((.(((((((.((........(((((((((.......((((((((((.(((.......).)).)))))))))).((((((..((((.........))))..))))))...((((((..((((...(((.........)))...)))))))))).......)))))))))(((.((...(((((((((((((((((((((............))))).....)))))..))))).))))))...)).)))...(((((((......)))))))((...((((((...))))))...)).(((((..((((((......))))))..)))))..(((.....))).....)).)))))))..))))))).....)))))))..))))..))))))))))........))))....)))))))))))(((....))).((((((.((((((((....(((...(((.((((((((....))))...........)))).)))))))))))))).((((((.........))))))(((((...)))))....)))))).....)))).)))).))).))).))).))).))).))).)))..........)).))...).))).)))))).....((((((.....))))))((..((((((((........))))))))..))((((((((((......................)))))))))))))))).....(((..(((((..(((((.......(((((.((.((((.((((((...))))))...)))).)))))))...)))))..))))).))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((({{..({{((,....{{||||||..((((((((....))).)))))....((((({....})))))((((((((((((.((..((((((((......)))))..................(((((.....))))))))..))))).))))))))).,|{(((((..((..(((((((..................))))))).,)}.)))))})}},.,)))))}|{{((((((((((((((((((((((.(({({.((((({,({,(({((.{,,,,..,(({,,.(((((((.((((.((.(((((((.{.(((((..((((((....),}))))..)))))....,.))))))).))...)))).))...)))))....))}(((((((((((({.,({((((((((,,.,,{{|||.(((((.((,{(((...)))))).)))))..(((((.....)))))....,||}}}.,,}|{{{.((((((((((((((...............)),,))).))...)))))).}}}}..(((((((.(((,.....{{{(,,,,,||}..}).|||||......))),)))).))).))))}))))})..}}}........,,}}}{{(((((((((.(((.{((..(((((.(((((((((.......)))))))))..)))))..))}.....(((......)))...)))..)))))))}),}}..|||},.)},.}},))))))))))...})))).)).)))}))}),(((((((.(((..,,,....(((((..(({(,,,,((((.(((.......))).)))).....})}))))..)))))))).))))))},{{{{....||}}|(((((.{{{(((.,,........}}}},,.)))))|||(((((((((((.....{{((....,,,((((.((((((..(((((((((((..{{{((((.((((((({(({{..{{,{(,,,|||||.....,,((((((((((.((,,,.....),)).)))))))))).((((((..((((.,.....,.))))..))))))...||||||,,||((,{,({{,,,,...,,||,..,|||}}|||||...{{{{,,,||||,|,...|..}}||,,,||||{(((((((((((............))))).....))))),.}}|||{|||||,...||{||,...{((((((,....,)))))))}},,}|,,|||}}}))),,,...{{.(((((..((((((......))))))..)))))}}.}|}}},}}),,,)}})}.,,))))}.}))))),,.....))))))}..))))..))))))))))........))))..,.|}|}|}}}}|}{((...,|||.,,||||}|||{{|||..,,{{{...(((.((((((((....))))...........)))).))))))))))))),,((((((.........))))))|,||,{{{,,|||,,..,,))))},..,))}),)))).))).))).))).))).))).))),))),.})))}......,,.((((({(({{(,,,..,{|,,{,.((((((((((({((..((((((((........))))))))..))|(((((((((......................)))))))))}..........)))))))))))..,|||,,..,}}}}))))))..||{|||,{{(((((...{({...,|||,,,}}}}}}}})))))})}....,.,......

Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_000639.3 AGCAGUCAGCAACAGGGUCCCGUCCUUGACACCUCAGCCUCUACAGGAC… 1805 nt 0.4693
NM_001302746.2 AGCAGUCAGCAACAGGGUCCCGUCCUUGACACCUCAGCCUCUACAGGAC… 1759 nt 0.4696
Summary

This gene is a member of the tumor necrosis factor superfamily. The primary function of the encoded transmembrane protein is the induction of apoptosis triggered by binding to FAS. The FAS/FASLG signaling pathway is essential for immune system regulation, including activation-induced cell death (AICD) of T cells and cytotoxic T lymphocyte induced cell death. It has also been implicated in the progression of several cancers. Defects in this gene may be related to some cases of systemic lupus erythematosus (SLE). Alternatively spliced transcript variants have been described. [provided by RefSeq, Nov 2014]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image