Basic Information

Symbol
FASN
RNA Class
mRNA
Alias
fatty acid synthase FAS SDR27X1 short chain dehydrogenase/reductase family 27X, member 1 [Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase 3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase Acyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase OA-519 type I fatty acid synthase Fatty acid synthase Type I fatty acid synthase EC 2.3.1.85 EC 6.3.3.1 EC 2.3.1
Location (GRCh38)
17:82078338-82098294 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_004104.5
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_004104.5
Sequence length
8464 nt
GC Content
0.6528

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3952.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -4081.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2114.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_004104.5 GAGCCAGAGAGACGGCAGCGGCCCCGGCCUCCCUCUCCGCCGCGCUUCA… 8464 nt 0.6528
Summary

The enzyme encoded by this gene is a multifunctional protein. Its main function is to catalyze the synthesis of palmitate from acetyl-CoA and malonyl-CoA, in the presence of NADPH, into long-chain saturated fatty acids. In some cancer cell lines, this protein has been found to be fused with estrogen receptor-alpha (ER-alpha), in which the N-terminus of FAS is fused in-frame with the C-terminus of ER-alpha. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
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