Basic Information
Symbol
FBXL5
RNA Class
mRNA
Alias
F-box and leucine rich repeat protein 5
FBL4
FBL5
FLR1
F-box/LRR-repeat protein 5
F-box protein FBL4/FBL5
p45SKP2-like protein
F-box and leucine-rich repeat protein 5
Location (GRCh38)
4:15604381-15681679
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_012161.4
Sequence length
3488 nt
GC Content
0.3942
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-966.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1035.35 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
902.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001193534.2 | GCCCCGCGGCGAGGGUGUCUAUGGAGAGGCGGCGGCCGCGGCUGCUGAG… | 3485 nt | 0.3943 |
| NM_001193535.2 | GCCCCGCGGCGAGGGUGUCUAUGGAGAGGCGGCGGCCGCGGCUGCUGAG… | 3437 nt | 0.3942 |
| NM_012161.4 | GCCCCGCGGCGAGGGUGUCUAUGGAGAGGCGGCGGCCGCGGCUGCUGAG… | 3488 nt | 0.3942 |
Summary
This gene encodes a member of the F-box protein family which is characterized by an approximately 40 amino acid motif, the F-box. The F-box proteins constitute one of the four subunits of ubiquitin protein ligase complex called SCFs (SKP1-cullin-F-box), which function in phosphorylation-dependent ubiquitination. The F-box proteins are divided into 3 classes: Fbws containing WD-40 domains, Fbls containing leucine-rich repeats, and Fbxs containing either different protein-protein interaction modules or no recognizable motifs. The protein encoded by this gene belongs to the Fbls class and, in addition to an F-box, contains several tandem leucine-rich repeats. Alternatively spliced transcript variants have been described for this locus. [provided by RefSeq, Aug 2010]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
