Basic Information
Symbol
FBXO7
RNA Class
mRNA
Alias
F-box protein 7
FBX7
Fbx
PARK15
F-box only protein 7
FBX07
PKPS
Location (GRCh38)
22:32474676-32498831
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_012179.4
Sequence length
2060 nt
GC Content
0.5010
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-657.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-696.67 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
681.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001033024.2 | ACGGGAGGCCCGGGCUCUUCCGGGCGUCGCGGAGCCGGAGGGUGCAGGC… | 1725 nt | 0.4899 |
| NM_001257990.2 | ACGGGAGGCCCGGGCUCUUCCGGGCGUCGCGGAGCCGGAGGGUGCAGGC… | 1877 nt | 0.4832 |
| NM_012179.4 | GCUCUAUUCCAGAGACCGAGUGGCAGGGCGGCCACUGUGGCGGGGCUCU… | 2060 nt | 0.5010 |
Summary
This gene encodes a member of the F-box protein family which is characterized by an approximately 40 amino acid motif, the F-box. The F-box proteins constitute one of the four subunits of the ubiquitin protein ligase complex called SCFs (SKP1-cullin-F-box), which function in phosphorylation-dependent ubiquitination. The F-box proteins are divided into 3 classes: Fbws containing WD-40 domains, Fbls containing leucine-rich repeats, and Fbxs containing either different protein-protein interaction modules or no recognizable motifs. The protein encoded by this gene belongs to the Fbxs class and it may play a role in regulation of hematopoiesis. Alternatively spliced transcript variants of this gene have been identified with the full-length natures of only some variants being determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
