Basic Information
Symbol
FBXW7
RNA Class
mRNA
Alias
F-box and WD repeat domain containing 7
AGO
FLJ11071
SEL-10
SEL10
FBW7
FBX30
CDC4
FBXW6
archipelago homolog (Drosophila)
F-box and WD-40 domain protein 7 (archipelago homolog, Drosophila)
F-box and WD repeat domain containing 7, E3 ubiquitin protein ligase
DEDHIL
FBW6
FBXO30
hAgo
hCdc4
F-box/WD repeat-containing protein 7
F-box protein FBW7
F-box protein FBX30
F-box protein SEL-10
archipelago
homolog of C elegans sel-10
Archipelago homolog
F-box and WD-40 domain-containing protein 7
Location (GRCh38)
4:152320544-152536107
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001349798.2
Sequence length
5639 nt
GC Content
0.4566
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1793.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1906.01 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1543.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001013415.2 | GCACUUCACCAAGCCUCAGACAGGUCAGGACAUUUGGUAGGGGAAGGUU… | 4301 nt | 0.3874 |
| NM_001257069.1 | GGAAACUUUACAAAAACAAAAUCCGGAGUCUCCCAAACCUGACUGUCCC… | 989 nt | 0.4388 |
| NM_001349798.2 | CUCUCUGGAGUGAGGCGAGAGCCCCGCACAGAGCGAGGGAGACAGCGAG… | 5639 nt | 0.4566 |
| NM_018315.5 | AGUCAAGGCUUUGACAGGGCAUAGUCUCCUCCAAUAAUCUUCUCCGUUC… | 4317 nt | 0.3910 |
| NM_033632.3 | UACCGCGCCGGAGCCUUCCGCAGCUGCCGCUUCAGUCCGAAGGAGGAAG… | 3927 nt | 0.4074 |
Summary
This gene encodes a member of the F-box protein family which is characterized by an approximately 40 amino acid motif, the F-box. The F-box proteins constitute one of the four subunits of ubiquitin protein ligase complex called SCFs (SKP1-cullin-F-box), which function in phosphorylation-dependent ubiquitination. The F-box proteins are divided into 3 classes: Fbws containing WD-40 domains, Fbls containing leucine-rich repeats, and Fbxs containing either different protein-protein interaction modules or no recognizable motifs. The protein encoded by this gene was previously referred to as FBX30, and belongs to the Fbws class; in addition to an F-box, this protein contains 7 tandem WD40 repeats. This protein binds directly to cyclin E and probably targets cyclin E for ubiquitin-mediated degradation. Mutations in this gene are detected in ovarian and breast cancer cell lines, implicating the gene's potential role in the pathogenesis of human cancers. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2012]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
