Basic Information
Symbol
FGGY
RNA Class
mRNA
Alias
FGGY carbohydrate kinase domain containing
FLJ10986
FGGY carbohydrate kinase domain-containing protein
D-ribulokinase
D-ribulokinase FGGY
EC 2.7.1.47
EC 2.7.1
Location (GRCh38)
1:59295910-59810647
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_018291.5
Sequence length
1873 nt
GC Content
0.4944
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-635.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-670.72 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
622.5
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001113411.2 | ACACCCGCCGGGCCGUUGUUCCCGAGACGUUGUUGAGUCCCCUGUGUCC… | 1942 nt | 0.4954 |
| NM_001244714.2 | CAAAGACUUCAACCCAUCUGUGACUUGGCAUUGUCUCUGAGGGGGGAAA… | 1694 nt | 0.4870 |
| NM_001278224.2 | GCCAGUCUUUCCCAUGCUGUUCUCGUGAUAGUAAGUCUCACAAGAUCUG… | 1166 nt | 0.4768 |
| NM_001350790.2 | CAAAGACUUCAACCCAUCUGUGACUUGGCAUUGUCUCUGAGGGGGGAAA… | 2030 nt | 0.4877 |
| NM_001350791.2 | CAAAGACUUCAACCCAUCUGUGACUUGGCAUUGUCUCUGAGGGGGGAAA… | 1962 nt | 0.4867 |
| NM_001350792.2 | CAAAGACUUCAACCCAUCUGUGACUUGGCAUUGUCUCUGAGGGGGGAAA… | 2125 nt | 0.4809 |
| NM_001350793.2 | GCCCCGGGACCGCCCUGCUCAGGCGCCGUGGGGUUCGGCGCGGCUACGU… | 2075 nt | 0.4887 |
| NM_001350794.2 | CAAAGACUUCAACCCAUCUGUGACUUGGCAUUGUCUCUGAGGGGGGAAA… | 1863 nt | 0.4815 |
| NM_001350795.2 | ACACCCGCCGGGCCGUUGUUCCCGAGACGUUGUUGAGUCCCCUGUGUCC… | 1678 nt | 0.4970 |
| NM_001350796.2 | GCCCCGGGACCGCCCUGCUCAGGCGCCGUGGGGUUCGGCGCGGCUACGU… | 1693 nt | 0.4885 |
Showing 1 to 10 of 14 entries
Summary
This gene encodes a protein that phosphorylates carbohydrates such as ribulose, ribitol, and L-arabinitol. Genome-wide association studies in some populations have found an association between polymorphisms in this gene and sporadic amyotrophic lateral sclerosis, but studies of other populations have not been able to replicate this association. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2013]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
