Basic Information

Symbol
FGGY
RNA Class
mRNA
Alias
FGGY carbohydrate kinase domain containing FLJ10986 FGGY carbohydrate kinase domain-containing protein D-ribulokinase D-ribulokinase FGGY EC 2.7.1.47 EC 2.7.1
Location (GRCh38)
1:59295910-59810647 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001113411.2
BLAST PRIMER
NM_001244714.2
BLAST PRIMER
NM_001278224.2
BLAST PRIMER
NM_001350790.2
BLAST PRIMER
NM_001350791.2
BLAST PRIMER
NM_001350792.2
BLAST PRIMER
NM_001350793.2
BLAST PRIMER
NM_001350794.2
BLAST PRIMER
NM_001350795.2
BLAST PRIMER
NM_001350796.2
BLAST PRIMER
NM_001350797.2
BLAST PRIMER
NM_001350798.2
BLAST PRIMER
NM_001350799.2
BLAST PRIMER
NM_018291.5
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_018291.5
Sequence length
1873 nt
GC Content
0.4944

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-635.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -670.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 622.5
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001350797.2 GCCCCGGGACCGCCCUGCUCAGGCGCCGUGGGGUUCGGCGCGGCUACGU… 1756 nt 0.4920
NM_001350798.2 GCCCCGGGACCGCCCUGCUCAGGCGCCGUGGGGUUCGGCGCGGCUACGU… 1670 nt 0.4838
NM_001350799.2 CAAAGACUUCAACCCAUCUGUGACUUGGCAUUGUCUCUGAGGGGGGAAA… 1751 nt 0.4854
NM_018291.5 ACACCCGCCGGGCCGUUGUUCCCGAGACGUUGUUGAGUCCCCUGUGUCC… 1873 nt 0.4944
Showing 11 to 14 of 14 entries
Summary

This gene encodes a protein that phosphorylates carbohydrates such as ribulose, ribitol, and L-arabinitol. Genome-wide association studies in some populations have found an association between polymorphisms in this gene and sporadic amyotrophic lateral sclerosis, but studies of other populations have not been able to replicate this association. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2013]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image