Basic Information
Symbol
FKBP5
RNA Class
mRNA
Alias
FKBP prolyl isomerase 5
FKBP51
FKBP54
PPIase
P54
Ptg-10
FK506-binding protein 5
FK506 binding protein 5
AIG6
peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP5
51 kDa FK506-binding protein
51 kDa FKBP
54 kDa progesterone receptor-associated immunophilin
FF1 antigen
FKBP-51
HSP90-binding immunophilin
PPIase FKBP5
T-cell FK506-binding protein
androgen-regulated protein 6
peptidylprolyl cis-trans isomerase
rotamase
Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP5
Androgen-regulated protein 6
FKBP-5
p54
Rotamase
EC 5.2.1.8
Location (GRCh38)
6:35572945-35728622
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_004117.4
Sequence length
3750 nt
GC Content
0.4317
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1060.88 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1132.04 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1059.6
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001145775.3 | AGAACAAACUCCUACCUCUGUUUGCAACUAAGAGUUACAUCCCCCAUGC… | 3935 nt | 0.4353 |
| NM_001145776.2 | AGUCUCGGGCGGCGGUGUCCGGCGCGCGGGCGGCCUGCUGGGCGGGCUG… | 3822 nt | 0.4385 |
| NM_001145777.2 | AGUCUCGGGCGGCGGUGUCCGGCGCGCGGGCGGCCUGCUGGGCGGGCUG… | 7357 nt | 0.4140 |
| NM_004117.4 | AGUCUCGGGCGGCGGUGUCCGGCGCGCGGGCGGCCUGCUGGGCGGGCUG… | 3750 nt | 0.4317 |
Summary
The protein encoded by this gene is a member of the immunophilin protein family, which play a role in immunoregulation and basic cellular processes involving protein folding and trafficking. This encoded protein is a cis-trans prolyl isomerase that binds to the immunosuppressants FK506 and rapamycin. It is thought to mediate calcineurin inhibition. It also interacts functionally with mature hetero-oligomeric progesterone receptor complexes along with the 90 kDa heat shock protein and P23 protein. This gene has been found to have multiple polyadenylation sites. Alternative splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, Mar 2009]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
