Basic Information
Symbol
FLG2
RNA Class
mRNA
Alias
filaggrin 2
IFPS
ifapsoriasin
filaggrin family member 2
PSS6
filaggrin-2
intermediate filament-associated and psoriasis susceptibility protein
Filaggrin-2
FLG-2
Intermediate filament-associated and psoriasis-susceptibility protein
Ifapsoriasin
Location (GRCh38)
1:152348735-152360006
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001014342.3
Sequence length
9124 nt
GC Content
0.4730
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2919.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-3080.07 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
2402.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001014342.3 | ACCCUGCAAGCUGCAUCAGGCUUUAUCCUACUUGUUCCUUUGGUGAACC… | 9124 nt | 0.4730 |
Summary
The filaggrin-like protein encoded by this gene is upregulated by calcium, proteolyzed by calpain 1, and is involved in epithelial homeostasis. The encoded protein is required for proper cornification in skin, with defects in this gene being associated with skin diseases. This protein also has a function in skin barrier protection. In fact, in addition to providing a physical barrier, C-terminal fragments of this protein display antimicrobial activity against P. aeruginosa and E. coli. [provided by RefSeq, Jul 2020]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
