Basic Information

Symbol
FNDC3B
RNA Class
mRNA
Alias
fibronectin type III domain containing 3B FAD104 DKFZp762K137 FLJ23399 PRO4979 YVTM2421 fibronectin type III domain-containing protein 3B HCV NS5A-binding protein 37 factor for adipocyte differentiation 104 NS5ABP37 Fibronectin type III domain-containing protein 3B Factor for adipocyte differentiation 104
Location (GRCh38)
3:172039547-172405418 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001135095.2
BLAST PRIMER
NM_022763.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_022763.4
Sequence length
8031 nt
GC Content
0.4272

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2234 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2391.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1897.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001135095.2 GGACUUGGCGAGCCGGCGGCUGGAAGCUCGGGCGGGGGAGCGGGGCGCG… 7931 nt 0.4249
NM_022763.4 AUUGACAUGGCGGAAUCCCCCAUCAAACCCUCCUGGUAGUUAUUUGAGC… 8031 nt 0.4272
Summary

Enables RNA binding activity. Predicted to act upstream of or within several processes, including negative regulation of osteoblast differentiation; substrate adhesion-dependent cell spreading; and type II pneumocyte differentiation. Predicted to be located in endoplasmic reticulum. [provided by Alliance of Genome Resources, Nov 2024]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image