Basic Information

Symbol
FOS
RNA Class
mRNA
Alias
Fos proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit c-fos AP-1 v-fos FBJ murine osteosarcoma viral oncogene homolog FBJ murine osteosarcoma viral oncogene homolog p55 protein c-Fos FBJ murine osteosarcoma viral (v-fos) oncogene homolog (oncogene FOS) Fos proto-oncogene, AP-1 trancription factor subunit G0/G1 switch regulatory protein 7 activator protein 1 cellular oncogene c-fos proto-oncogene c-Fos transcription factor AP-1 subunit c-Fos G0S7 Protein c-Fos Cellular oncogene fos Proto-oncogene c-Fos Transcription factor AP-1 subunit c-Fos
Location (GRCh38)
14:75278826-75283190 UCSC Genome Browser

Secondary Structure

MANE Select
NM_005252.4
Sequence length
2104 nt
GC Content
0.5276

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-722.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -764.1 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 539.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((...(((((((((((((((((.((((((((((((.((.((.((((((((.((......)).))).)))))..))...)).))))((((....)))).....((((.((((((.....((((((((((..(((((((...........((((((((.((((....((......))...))))))))))))...((((((((((((.(((..((((((.(((((..(..((((................).)))..)..))))).)).))))..)))))).......((((.....)))).(((((.(((.((....(((((((..............)).)))))......)).))))))))...)))))))))..((((.....))))((((((((((.(((((.(...((((((.((((...((((.........(((((....(((((.......)))))..)))))))))))))..)))))).).)))))..)))))).)))).)))))))...)))..)))))))..))))))))))((((((((((((((((((((...((((((((.....((((((((((.......((.(((.((.....)).))).))((((.(((((((((.(((((...((((....))))((((((.................((((((...)))))).((..((((...(((.....)))...((((..(((....)))..))))(((((.((...)).))))).))))..)).........(((((...))))).......)))))).(((...((((((((.(((((((((..(((((.((((.((.....))....(((((((((.........)))..))))))..))))))).))....)))))))))))).....)))))))))))))))))..((.(((........))))).........))))).))))..((((.(((((((((...((((((...((((((..(((...((((((....((((((....)))))).(((((((.((((.(((((((....(((((((.((((((..((...((.((((...)))).))...)))))))).)))))))....(((....)))....)))))))))))..((((...((((((((..(((.............)))(((((.((((((((((((((....)))))(((..((((.(((((((((((((..(((((.............)))))))).......)))))).))))))))..)))...)))))))))...)))))(((((......)))))...((((((((((((((((((((((((((.........((((((((...(((((......))))))))))))))))).)))))).))).....))))).))).)))))...((((((((((..((((....))))....)))))))))).........))))))))))))....)))))))((((.(((((....))))))))).........))))))...))).)).)))))))))))))))))))..)))).))))))))))))))))))..))))))..(((......)))...((((((..(((((...((......))..(((((((((((.........)))))))))))..((((((..((((...((((.(((.......))).)))).))))..)))))).)))))))))))...........((((......)))).)))))))).))))))........(((((((.........)))))))...((((((((...(((.(((..(((....)))))).)))....)))))))).))))).(((((....)))))(((.((((((...))))))))).........(((((((......)))))))))).))))))))).......(((((((((.((((((((((((......(((....)))..)))))))).))))..)))))))))...((((((.....))))))..))))...(((...)))...............)))).))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((((...({({{{{|(((((((({.(((,{,{,((((.((.((.((((((((.((......)).))).)))))..))...)).)))),(({....}))}.,...((((((((((...((((((((((..((((..((((...........(((((((,,((((,,,.,,......),,..)))))))))))).....((((((((|{,{{((((((....)))))).))|,.(((((.{.((,{{...((((...(((((((((((((..(((((((((.((({,(..(((((...,,....(((({,(((.((....(((((((..............)).)))))......)).))))))))}.))))).))))).)))).)))))((.((((((((((.(((((.,.,.((((((.((({.,,{{,,..,,,,...(((((....(((((.......)))))..)))))))))))))..)))))).).)))))..))))))}}))).))...))..))).)))))))),...))))...,,,..(((((.................))))).(((....)))..)),.))))).,))))))))........))))))))..))))).)))))..{........,..))))))))))..,.(((((((((((({..((((((...))))))....(((((({....((({(((((((((((.{({..((((..{{{{{.((({(,((,..|}.|||||{{{.,{.{{.((({,{.{((((({,,|||||{{{,{{,,{{{{.{({,{|,{{,{,{||.,{{{||(((,.{{{||,|||{|||.,,,,||.{{{(((((((({,........)}}}}}))))}..)))))|||}}....},})))))})),..,|||}}||,{{,{{{|{,(({{({,((||,..,{,{{{{{|,,|(({{,,...{{{....}})},}}}||{{|||{..,{|||||,..||{|||,,||||||{({{(({...((((((....)))))).,}|.,((,((((.(((((((....(((((((.((((((..((...((.((((...)))).))...)))))))).)))))))...,{{{,...})),,..)))))))))))..|||{...{((((,,{,..{{,.............|}||{{||(((((((((,{(((....))))|(((.,({({{(((((((((({({..(((((...,....,,...)})))))),......))))))}}))))})).}))))),))))))))).{{|||}}(((((......))))).,,|||{,((((((((((((((((({(((.........(((((((({,.{((({......})))))))))))))))}.)))))).))).....)))))}})),))))),,,((((((((((..{{{(,,...,})},,.))))))))))..,,,,...)))))})}}|||..,,}|||||||||{}|{{||,...)))})}))),)))}.},,))}))},..})),)}.))})))))}}})))})))),,)}},))))})).))))))))))))))...{{{{(((.{{,....}}}))}},))|,,.{{{.(((((((((..((,{((((((((((.........))))))))))))).))))))))},}}}||{....||,,...}))))))|{((({{{,{..((((..{{({......})}}.))))....}}))))..,))))))))))))).,..,,{,,...{,(({((((.....,,,,)))}))),}}{(((((((...(((.(((..({{....))}))).)))....))))))))}))})},{,,,{,,..|||,|{{{.((((((...))))))},..,,.,}}..(((((((......)))))))))).})))))))).......(((((((((.((((((((((((......(((....)))..)))))))}.)))}..)))))))))...{(((((.....)))))}.{{{|.,,.|||..,}|},,,,...}},..,..)))),))))).

Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_005252.4 AACCGCAUCUGCAGCGAGCAUCUGAGAAGCCAAGACUGAGCCGGCGGCC… 2104 nt 0.5276
Summary

The Fos gene family consists of 4 members: FOS, FOSB, FOSL1, and FOSL2. These genes encode leucine zipper proteins that can dimerize with proteins of the JUN family, thereby forming the transcription factor complex AP-1. As such, the FOS proteins have been implicated as regulators of cell proliferation, differentiation, and transformation. In some cases, expression of the FOS gene has also been associated with apoptotic cell death. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image