Basic Information

Symbol
FOXO1
RNA Class
mRNA
Alias
forkhead box O1 FKH1 forkhead homolog in rhabdomyosarcoma FKHR FOXO1A forkhead box protein O1 forkhead box protein O1A forkhead, Drosophila, homolog of, in rhabdomyosarcoma Forkhead box protein O1 Forkhead box protein O1A Forkhead in rhabdomyosarcoma
Location (GRCh38)
13:40555667-40667612 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_002015.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_002015.4
Sequence length
5779 nt
GC Content
0.4662

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1827.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1939.91 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1527.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_002015.4 GAUCCCGUAAGUCGGGCGGCCUGGUAGUCGCAGCAGCCGCUGCCGCAGC… 5779 nt 0.4662
Summary

This gene belongs to the forkhead family of transcription factors which are characterized by a distinct forkhead domain. The specific function of this gene has not yet been determined; however, it may play a role in myogenic growth and differentiation. Translocation of this gene with PAX3 has been associated with alveolar rhabdomyosarcoma. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image