Basic Information
Symbol
FOXP1
RNA Class
mRNA
Alias
forkhead box P1
QRF1
12CC4
HSPC215
hFKH1B
fork head-related protein like B
glutamine-rich factor 1
PAX5/FOXP1 fusion protein
MFH
forkhead box protein P1
mac-1-regulated forkhead
Forkhead box protein P1
Mac-1-regulated forkhead
Location (GRCh38)
3:70954693-71584009
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001349338.3
Sequence length
7177 nt
GC Content
0.4314
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1982.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-2122.58 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
2301.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
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Summary
This gene belongs to subfamily P of the forkhead box (FOX) transcription factor family. Forkhead box transcription factors play important roles in the regulation of tissue- and cell type-specific gene transcription during both development and adulthood. Forkhead box P1 protein contains both DNA-binding- and protein-protein binding-domains. This gene may act as a tumor suppressor as it is lost in several tumor types and maps to a chromosomal region (3p14.1) reported to contain a tumor suppressor gene(s). Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
