Basic Information
Symbol
FUT6
RNA Class
mRNA
Alias
fucosyltransferase 6
FT1A
FCT3A
FucT-VI
FLJ40754
alpha-(1,3)-fucosyltransferase
galactoside 3-L-fucosyltransferase
Fuc-TVI
4-galactosyl-N-acetylglucosaminide 3-alpha-L-fucosyltransferase FUT6
alpha-(1,3)-fucosyltransferase 6
fucosyltransferase 6 (alpha (1,3) fucosyltransferase)
fucosyltransferase VI
Fucosyltransferase 6
Fucosyltransferase VI
Galactoside 3-L-fucosyltransferase
EC 2.4.1.152
EC 2.4.1
EC 2.4.1.65
Location (GRCh38)
19:5830361-5839722
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_000150.4
Sequence length
3326 nt
GC Content
0.5809
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1357.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1410.19 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
777.43
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_000150.4 | AUUCCAGGAAGUUUGCAUAGCUCCCUGGACUUCUGCUUUGCACUGCCCU… | 3326 nt | 0.5809 |
| NM_001040701.2 | ACACUUCCUCCUUCCUUCUGCUGCGUGGUGUGGCCUCUUCCACGUCCUC… | 2288 nt | 0.5975 |
| NM_001369502.1 | ACACUUCCUCCUUCCUUCUGCUGCGUGGUGUGGCCUCUUCCACGUCCUC… | 2461 nt | 0.5949 |
| NM_001369504.1 | ACACUUCCUCCUUCCUUCUGCUGCGUGGUGUGGCCUCUUCCACGUCCUC… | 2616 nt | 0.5925 |
| NM_001369505.1 | ACACUUCCUCCUUCCUUCUGCUGCGUGGUGUGGCCUCUUCCACGUCCUC… | 2642 nt | 0.5920 |
| NM_001381955.1 | ACACUUCCUCCUUCCUUCUGCUGCGUGGUGUGGCCUCUUCCACGUCCUC… | 2488 nt | 0.5928 |
| NM_001381956.1 | ACACUUCCUCCUUCCUUCUGCUGCGUGGUGUGGCCUCUUCCACGUCCUC… | 2613 nt | 0.5913 |
| NM_001381957.1 | ACACUUCCUCCUUCCUUCUGCUGCGUGGUGUGGCCUCUUCCACGUCCUC… | 2172 nt | 0.5962 |
| NM_001381958.1 | ACACUUCCUCCUUCCUUCUGCUGCGUGGUGUGGCCUCUUCCACGUCCUC… | 2598 nt | 0.5982 |
| NM_001381959.1 | ACACUUCCUCCUUCCUUCUGCUGCGUGGUGUGGCCUCUUCCACGUCCUC… | 2300 nt | 0.5957 |
Summary
The protein encoded by this gene is a Golgi stack membrane protein that is involved in the creation of sialyl-Lewis X, an E-selectin ligand. Mutations in this gene are a cause of fucosyltransferase-6 deficiency. Two transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
