Basic Information
Symbol
GABRA1
RNA Class
mRNA
Alias
gamma-aminobutyric acid type A receptor subunit alpha1
EJM5
GABA(A) receptor, alpha 1
gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, alpha 1
DEE19
ECA4
EIEE19
EJM
gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1
GABA(A) receptor subunit alpha-1
GABAAR subunit alpha-1
gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha1 subunit
Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1
Location (GRCh38)
5:161847063-161899981
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001127644.2
Sequence length
4238 nt
GC Content
0.3733
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1074.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1157.26 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
954.63
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_000806.5 | AACAGAAGAUGCCGGAGAAGGGGGGGGAAAAGUAGAUGCGGAUUUCGUC… | 4376 nt | 0.3761 |
| NM_001127643.2 | AGUUUCAGAGCUUGCGUUCAUUCAUAUGCAGGCAGUGGUUUAAUAUUUG… | 4223 nt | 0.3730 |
| NM_001127644.2 | CUAUUUCACAUCCGGUUUGCCCUGGGACGUAUUACUACUGUCUUGGUAA… | 4238 nt | 0.3733 |
| NM_001127645.2 | GGAGAGCGAGCGAGCGAGCAAGGGAGCGAGCAGGACAGGAGCCUGAUCC… | 3992 nt | 0.3655 |
| NM_001127646.1 | GGAAGGCACGCUCUUGUCCUGGCUGCAAAAUUGCCUGUUUUUCCCUUUC… | 4067 nt | 0.3656 |
| NM_001127647.1 | AGCUUAAAAAUUUUAAUGCACAGUUCACUGUGGAAACUGAAAUCUUAAA… | 4223 nt | 0.3597 |
| NM_001127648.2 | AGUCAGCCCUGGUGGUUAUAACCUGAUGUUUCUUGCUAGAGACAUUGAU… | 4006 nt | 0.3617 |
Summary
This gene encodes a gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor. GABA is the major inhibitory neurotransmitter in the mammalian brain where it acts at GABA-A receptors, which are ligand-gated chloride channels. Chloride conductance of these channels can be modulated by agents such as benzodiazepines that bind to the GABA-A receptor. GABA-A receptors are pentameric, consisting of proteins from several subunit classes: alpha, beta, gamma, delta and rho. Mutations in this gene cause juvenile myoclonic epilepsy and childhood absence epilepsy type 4. Multiple transcript variants encoding the same protein have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
