Basic Information
Symbol
AKAP4
RNA Class
mRNA
Alias
A-kinase anchoring protein 4
p82
hAKAP82
AKAP82
Fsc1
HI
CT99
A-kinase anchor protein 82 kDa
testis-specific gene HI
protein kinase A anchoring protein 4
cancer/testis antigen 99
A kinase (PRKA) anchor protein 4
AKAP 82
AKAP-4
PRKA4
A-kinase anchor protein 4
epididymis secretory sperm binding protein
major sperm fibrous sheath protein
Major sperm fibrous sheath protein
Protein kinase A-anchoring protein 4
Location (GRCh38)
X:50190777-50201007
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_003886.3
Sequence length
2866 nt
GC Content
0.4627
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-845.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-900.35 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
790.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_003886.3 | GGCAGUCAAGGCUGUAGGAGGGCAUGGAGAGUUGAAGAAAAAAGCAGUA… | 2866 nt | 0.4627 |
| NM_139289.2 | AGUCUGGUCCAACAGCUGACAGGGGUGGCAGCCAACUGCAGGUGCCCAA… | 2864 nt | 0.4651 |
Summary
The A-kinase anchor proteins (AKAPs) are a group of structurally diverse proteins, which have the common function of binding to the regulatory subunit of protein kinase A (PKA) and confining the holoenzyme to discrete locations within the cell. This gene encodes a member of the AKAP family. The encoded protein is localized to the sperm flagellum and may be involved in the regulation of sperm motility. Alternative splicing of this gene results in two transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
