Basic Information
Symbol
ABCC1
RNA Class
mRNA
Alias
ATP binding cassette subfamily C member 1 (ABCC1 blood group)
GS-X
glutathione S-conjugate export pump
multidrug resistance associated protein 1
ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 1
ATP binding cassette subfamily C member 1
ABC29
ABCC
DFNA77
MRP
MRP1
multidrug resistance-associated protein 1
ATP-binding cassette transporter variant ABCC1delta-ex13
ATP-binding cassette transporter variant ABCC1delta-ex13&14
ATP-binding cassette transporter variant ABCC1delta-ex25
ATP-binding cassette transporter variant ABCC1delta-ex25&26
LTC4 transporter
glutathione-S-conjugate-translocating ATPase ABCC1
leukotriene C(4) transporter
Multidrug resistance-associated protein 1
ATP-binding cassette sub-family C member 1
Glutathione-S-conjugate-translocating ATPase ABCC1
Leukotriene C(4) transporter
EC 7.6.2.2
EC 7.6.2.3
EC 3.6.3
EC 3.6.3.44
Location (GRCh38)
16:15949138-16143257
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_004996.4
Sequence length
6504 nt
GC Content
0.5487
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2405.71 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-2519.29 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1780.86
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_004996.4 | GCCGCCGCCGCCGCCGCCAGCGCUAGCGCCAGCAGCCGGGCCCGAUCAC… | 6504 nt | 0.5487 |
| NM_019862.3 | GCCGCCGCCGCCGCCGCCAGCGCUAGCGCCAGCAGCCGGGCCCGAUCAC… | 6327 nt | 0.5488 |
| NM_019898.2 | CCAGGCGGCGUUGCGGCCCCGGCCCCGGCUCCCUGCGCCGCCGCCGCCG… | 6396 nt | 0.5488 |
| NM_019899.2 | CCAGGCGGCGUUGCGGCCCCGGCCCCGGCUCCCUGCGCCGCCGCCGCCG… | 6219 nt | 0.5488 |
| NM_019900.2 | CCAGGCGGCGUUGCGGCCCCGGCCCCGGCUCCCUGCGCCGCCGCCGCCG… | 6369 nt | 0.5472 |
| NM_019901.1 | CCAGGCGGCGUUGCGGCCCCGGCCCCGGCUCCCUGCGCCGCCGCCGCCG… | 5801 nt | 0.5685 |
| NM_019902.1 | CCAGGCGGCGUUGCGGCCCCGGCCCCGGCUCCCUGCGCCGCCGCCGCCG… | 5780 nt | 0.5680 |
Summary
The protein encoded by this gene is a member of the superfamily of ATP-binding cassette (ABC) transporters. ABC proteins transport various molecules across extra-and intra-cellular membranes. ABC genes are divided into seven distinct subfamilies (ABC1, MDR/TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). This full transporter is a member of the MRP subfamily which is involved in multi-drug resistance. This protein functions as a multispecific organic anion transporter, with oxidized glutatione, cysteinyl leukotrienes, and activated aflatoxin B1 as substrates. This protein also transports glucuronides and sulfate conjugates of steroid hormones and bile salts. Alternatively spliced variants of this gene have been described but their full-length nature is unknown. [provided by RefSeq, Apr 2012]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
