Basic Information

Symbol
ABCC1
RNA Class
mRNA
Alias
ATP binding cassette subfamily C member 1 (ABCC1 blood group) GS-X glutathione S-conjugate export pump multidrug resistance associated protein 1 ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 1 ATP binding cassette subfamily C member 1 ABC29 ABCC DFNA77 MRP MRP1 multidrug resistance-associated protein 1 ATP-binding cassette transporter variant ABCC1delta-ex13 ATP-binding cassette transporter variant ABCC1delta-ex13&14 ATP-binding cassette transporter variant ABCC1delta-ex25 ATP-binding cassette transporter variant ABCC1delta-ex25&26 LTC4 transporter glutathione-S-conjugate-translocating ATPase ABCC1 leukotriene C(4) transporter Multidrug resistance-associated protein 1 ATP-binding cassette sub-family C member 1 Glutathione-S-conjugate-translocating ATPase ABCC1 Leukotriene C(4) transporter EC 7.6.2.2 EC 7.6.2.3 EC 3.6.3 EC 3.6.3.44

Secondary Structure

MANE Select
NM_004996.4
Sequence length
6504 nt
GC Content
0.5487

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2405.71 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2519.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1780.86
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_004996.4 GCCGCCGCCGCCGCCGCCAGCGCUAGCGCCAGCAGCCGGGCCCGAUCAC… 6504 nt 0.5487
NM_019862.3 GCCGCCGCCGCCGCCGCCAGCGCUAGCGCCAGCAGCCGGGCCCGAUCAC… 6327 nt 0.5488
NM_019898.2 CCAGGCGGCGUUGCGGCCCCGGCCCCGGCUCCCUGCGCCGCCGCCGCCG… 6396 nt 0.5488
NM_019899.2 CCAGGCGGCGUUGCGGCCCCGGCCCCGGCUCCCUGCGCCGCCGCCGCCG… 6219 nt 0.5488
NM_019900.2 CCAGGCGGCGUUGCGGCCCCGGCCCCGGCUCCCUGCGCCGCCGCCGCCG… 6369 nt 0.5472
NM_019901.1 CCAGGCGGCGUUGCGGCCCCGGCCCCGGCUCCCUGCGCCGCCGCCGCCG… 5801 nt 0.5685
NM_019902.1 CCAGGCGGCGUUGCGGCCCCGGCCCCGGCUCCCUGCGCCGCCGCCGCCG… 5780 nt 0.5680
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the superfamily of ATP-binding cassette (ABC) transporters. ABC proteins transport various molecules across extra-and intra-cellular membranes. ABC genes are divided into seven distinct subfamilies (ABC1, MDR/TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). This full transporter is a member of the MRP subfamily which is involved in multi-drug resistance. This protein functions as a multispecific organic anion transporter, with oxidized glutatione, cysteinyl leukotrienes, and activated aflatoxin B1 as substrates. This protein also transports glucuronides and sulfate conjugates of steroid hormones and bile salts. Alternatively spliced variants of this gene have been described but their full-length nature is unknown. [provided by RefSeq, Apr 2012]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image