Basic Information

Symbol
ALAS2
RNA Class
mRNA
Alias
5'-aminolevulinate synthase 2 ALAS-E sideroblastic/hypochromic anemia erythroid-specific delta-aminolevulinate synthase aminolevulinate, delta-, synthase 2 (sideroblastic/hypochromic anemia) aminolevulinate, delta-, synthase 2 ALASE ANH1 ASB SIDBA1 XLDPP XLEPP XLSA 5-aminolevulinate synthase, erythroid-specific, mitochondrial 5-aminolevulinic acid synthase 2 delta-ALA synthase 2 delta-ALA synthetase delta-aminolevulinate synthase 2 Delta-ALA synthase 2 Delta-aminolevulinate synthase 2 EC 2.3.1.37

Secondary Structure

MANE Select
NM_000032.5
Sequence length
1940 nt
GC Content
0.5479

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-700.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -735.73 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 618.5
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_000032.5 ACCUGUCAUUCGUUCGUCCUCAGUGCAGGGCAACAGGACUUUAGGUUCA… 1940 nt 0.5479
NM_001037967.4 ACCUGUCAUUCGUUCGUCCUCAGUGCAGGGCAACAGGACUUUAGGUUCA… 1829 nt 0.5484
NM_001037968.4 ACCUGUCAUUCGUUCGUCCUCAGUGCAGGGCAACAGGGCCCACAUGCCU… 1936 nt 0.5491
NM_001037969.2 AAUGCAGGGCCAGGCCGGCAGAAGGCAGGGUGGGUGGGGCUGAGUCAGA… 2300 nt 0.5317
Summary

The product of this gene specifies an erythroid-specific mitochondrially located enzyme. The encoded protein catalyzes the first step in the heme biosynthetic pathway. Defects in this gene cause X-linked pyridoxine-responsive sideroblastic anemia. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image