Basic Information
Symbol
GYPA
RNA Class
mRNA
Alias
glycophorin A (MNS blood group)
GPA
MN
CD235a
PAS-2
glycophorinA
MN sialoglycoprotein
sialoglycoprotein alpha
glycophorin A (includes MN blood group)
glycophorin A (MN blood group)
GPErik
GPSAT
HGpMiV
HGpMiXI
HGpSta(C)
MNS
glycophorin-A
Mi.V glycoprotein (24 AA)
erythroid-lineage-specific membrane sialoglycoprotein
glycophorin A transcript
glycophorin A, GPA
glycophorin Erik
glycophorin MiI
glycophorin MiV
glycophorin SAT
glycophorin Sta type C
recombinant glycophorin A-B Miltenberger-DR
Glycophorin-A
Sialoglycoprotein alpha
CD235a antigen
Location (GRCh38)
4:144109303-144140751
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_002099.8
Sequence length
2627 nt
GC Content
0.3384
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-559.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-614.32 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
797.93
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001308187.2 | AGGCUAAGGUCAGACACUGACACUUGCAGUUGUCUUUGGUAGUUUUUUU… | 2588 nt | 0.3366 |
| NM_001308190.2 | AGGCUAAGGUCAGACACUGACACUUGCAGUUGUCUUUGGUAGUUUUUUU… | 2528 nt | 0.3362 |
| NM_002099.8 | AGGCUAAGGUCAGACACUGACACUUGCAGUUGUCUUUGGUAGUUUUUUU… | 2627 nt | 0.3384 |
Summary
Glycophorins A (GYPA) and B (GYPB) are major sialoglycoproteins of the human erythrocyte membrane which bear the antigenic determinants for the MN and Ss blood groups. In addition to the M or N and S or s antigens that commonly occur in all populations, about 40 related variant phenotypes have been identified. These variants include all the variants of the Miltenberger complex and several isoforms of Sta, as well as Dantu, Sat, He, Mg, and deletion variants Ena, S-s-U- and Mk. Most of the variants are the result of gene recombinations between GYPA and GYPB. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
