Basic Information
Symbol
H1-8
RNA Class
mRNA
Alias
H1.8 linker histone
H1 histone family, member O, oocyte-specific
H1 histone family member O oocyte specific
H1.8
H1FOO
H1oo
osH1
histone H1.8
histone H1oo
oocyte-specific histone H1
oocyte-specific linker histone H1
H1OO
OSH1
Histone H1.8
Histone H1oo
Oocyte-specific histone H1
Oocyte-specific linker histone H1
Location (GRCh38)
3:129543175-129551467
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_153833.3
Sequence length
1212 nt
GC Content
0.6040
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-514.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-536.52 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
256.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001308262.2 | UGCGUCACAGCAGGACCAGGCGGCUAAGCAGGGAGAAGAGCCAGAGGGG… | 882 nt | 0.5794 |
| NM_153833.3 | CUCACACCCGGGUGAGGGGUCUGCUGGCUGCACCUGUCGGUCUCAUGGC… | 1212 nt | 0.6040 |
Summary
Histones are basic nuclear proteins that are responsible for the nucleosome structure of the chromosomal fiber in eukaryotes. Nucleosomes consist of approximately 146 bp of DNA wrapped around a histone octamer composed of pairs of each of the four core histones (H2A, H2B, H3, and H4). The chromatin fiber is further compacted through the interaction of a linker histone, H1, with the DNA between the nucleosomes to form higher order chromatin structures. The protein encoded is a replication-independent histone that is a member of the histone H1 family. This gene contains introns, unlike most histone genes. The related mouse gene is expressed only in oocytes. [provided by RefSeq, Oct 2015]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
