Basic Information
Symbol
HDAC9
RNA Class
mRNA
Alias
histone deacetylase 9
KIAA0744
HDAC
MITR
HD7
HDAC7B
ARCND4
HD7b
HD9
HDAC7
HDAC9B
HDAC9FL
HDRP
MEF-2 interacting transcription repressor (MITR) protein
histone deacetylase 4/5-related protein
histone deacetylase 7B
Histone deacetylase 9
Histone deacetylase 7B
Histone deacetylase-related protein
MEF2-interacting transcription repressor MITR
EC 3.5.1.98
Location (GRCh38)
7:18086949-19002416
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_178425.4
Sequence length
9880 nt
GC Content
0.4020
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2622 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-2812.67 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
2632.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((.(((((...(((((((((....(((((((((((((...(((.((((.(((((((((((......))))))))..))))))))))..)))).)))).))).......((((((((.((..(((.(((((...........))))).)))...)).)))))))).........))...)))))))))......((((.(((((((.(.(((..........))).).))))))))))).....))))))))))))(((((.....((.(((((...(((((.((((((...))))))..)))))..((((.(((((.((((((........((((((.(((((....(((((((((((((.....)))).((((((.......(((.(((.....))).)))((.(((.....))).))((((......)))))))))).((....)).)))))))))))))).))))))((((((.((((((...((((((...)))))).(((((.(((((.((((((((((((...........(((((((.....((((........)))).....(((((.(....).)))))(((((((.((((........((.....))....((((.(((((((((((.(((.(((((((((.(((((((((....(.((((((((((.(((.....(((((.........)))))...(((.(((((((.((..(((((((.(...((((.(((((.........)))))..((((((...((((.....))))....)).....))))......((((((.......))))))((((...........))))..)))).).))))))).(((((.....((((.((((((...(((((......))))).....(((((...((.(((((((((....(((.(((.....)))((((((((((((((((((((((......((......)).....))))))).).))..(((((.(((....((((((((((((.((.((.((.(((((.((((.(((.((.(((..........((((((((((..((.........))..))))))))))(((..((((.(((((((((.(..(((((....(((.((((.............))))))).)))))).)))))))))...))))..)))(((...))).))).))))).((((...((...((......))))...)))).....((((((.......)))))).((((...(((((.((((.(((.(((((((((((((.......)))))((.....))((((...((..(((.....)))..))...))))))))))..)).))).)))))))))))))..((((((((((((....))).))))))))))))).)).))).)).))))(((........)))...))).))))))))).(((((((..(((((....((.((((....)))))).(((..((((((.((........)).))))))..)))....((((......)))))))))..)))))))..........((((.(((........))).)))).))).)))))((((((((((.....((((((((((..(((.((((((((((((.(....((..(((((.(((((((((..((((......)))).((((((.........((..(.((((......)))).)..)).........))))))(((((...............)))))(((((......)))))..............)))))........))))..)))))))....).))))))))(((((((((((((((((((((((((.(((.(((((((.......)))))))(((..((((.((.((.(((((.....))))).)).))..))))..)))((((((((((((((((...(((.((((.(((((...(((((.....((((((((((((..((((((((..((((((...........))))))))))))))..)))(((((....))))).(((((((.(((((.(((((((.....))))..))).))).)).).)))))).....((((.((((((((((....(((((((.((....((((..(((((((((((.(((((..((..(((((.(((((((.((((((.......((((((((((...(((.(.(((.((......)).))).).)))...))))))))))....(.(((.((((..((((..(((.......((((((((((..(........)..)))))).)))).......))).))))..)))).))).)...)))))).)))))))..(((((((.((((((...)))))).........)))))))((......))....)).))).))...)))))((((((((.((((.(.(((((((((...................))))))))).).))))..)))))))).((((((.(((((....(((.((((.....))))))))))).........).))))))(((((((((.((.((((((...(((..(.(((((((.((.(((..............))).)).))))))))..)))...))).))))).))...))))))).((((((((((((......(((((((((((((((.......(((((((....................)))).))))))))))))..)))))).....(((.(((((.(((.(((.(((((......((((((....)))))))))))...........((((.....))))..))).))).))))).))).))))))))))))..))))).))))))))))...)).))))))).(((((....)))))))))))...((((((((.......(((((((..(((.((.((.(((.(((...)))))))))).)))....)))))))((((.(.(((.(((((((.((.(((......)))))))))))).))).).))))))))))))..((((((....))))))...........(((..((((((...((((.(((......))).)))))))))).))))))))))).((((((((((.....(((((..((((.(((.((((((....))))))((((.(((....)))))))........(((((........)))))(((((((...(((((((................((((((((((((((.(((((((((...(((..((...))..))))))).)))))..(((...(((((((..((((.(((((.((..(((((((((((((.((....))(((((((..(((((.(.((((((...........(((((.(((((..((..((........((((..((((((.........))))))...)))).....))..))..)).))))))))....((((.(((..((((((.............(((((((((((...(((((...(((...((((((..(((....((((((.....)))))).)))..))))))....))).)))))(((((((((...(((((((............(((((.(((...((((((((.((.....)).)))))))).......((((.....(((....(((((((((....))))))))).....)))...))))))).))))).((((((((.......))))))))))).)))).....((((.....))))((((.(((((((((((.....((.(((((........((((((...(((.....)))...)))))))))))))((((.((((......((((....)))).......)))).))))((((((.....((((((...))))))......((((....))))....(((...))).......(((.......))).)))))).)).))))))))).))))..(((..((((..((((((((((........)))))))))).))))..)))..((((((.(((..(.(((.(((((..((((..(((.....)))..))))..))))).))).).....)))...)))))).........((((((....((((..(((...)))..))))......))))))...........))))))))))))))))))))(((((.(((....))))))))((((.((((((((((.............................))))))))))..))))((((((.(((((((((...(((((..(((((...))))).(((((((((.......)))))))))))))).....))))))).)).))))))...))))))...))))))).......))))))))))))..)))))))...........(((((((...((((.(((((((((((.....))))((((((....))))))((((.........))))((..((((.((((.........((((((.((((..((((..((((((((...(((......)))......)))))))).))))..)))).))))))(((((((((((....))))..........((((((((.(((((((...((((((((.((((....(((((((........)))))..))....)))).))))))))((((..............))))..............(((.(((.((((.(((((.((..............)).))))).)))).)))..))).......((((((((((.......))))))))))..........................)))))))...))))))))..........(((((((...))))))).((((((...........))))))...(((((((.......))))))).((((((((((........))))))))))........))))))))))).)))).)).....(((((....))))).((((((((.........)))))))).)))))))..)))).))))))).(((((((.((((((((((..(((((((....)))))))(((((...(((((.((((....)))).....(((......)))......)))))...)))))..)))))))))))))))))((((((.((((((((((............((((((((((((((.....((((.(((....(((((.(((..(((........((((((....))))))...(((.......))).....((((((((...((((..((...((((((((..(((((.......((((((((((((((........(((((......).))))(((((((((((((......))).))))))))))............)))))))..)))))))......)))))..))))))))...)).))))...........((.(((((...))))).)).............))))))))...(((((((((((((((..((((.(...(((((((((.((((........)))).))))))))).....((((.....(((....))).....))))((((((((((.........))))))))))......).))))..)))))))............)))))))).)))..))).)))))..))).)))).((((.....(((((((...(((((........(((....))).)))))..))))))).....))))...(((....((((...........))))....)))..((((........)))).......)))))))))))))).))))))))))))))))..(((((((........)))))))..((((((.(((.((.(((((.((....)).))))).)).))).))))))....)))))))))))))..)).))))...((((((((((((((...((((....(((....))).....((((.......(((((((.((((......(.(((((((((.((((((((....................((((((((.(((((..(((((((((.((.((((((..........))).))).))((((((.(((.......)))...))))))...)).)))))))((((((.((((...((((.....))))........(((((.....)))))..((((((.....))))))..(((((((((((((((.....(((((...........)))))...........((((((.........))))))........................))))).)))))))))).....(((...)))...........))))))))))......(((((........)))))..)))))))))))))(((((((...................))))))).........)))))))).))).....(((..((((...(((((....)))))..(((((((......(((...((((((((..(((....)))..)))))))))))......))))))).))))))).)))))).).......)))).)))))))((((.........((((((.......((((.....))))...))))))))))......(((((((((.((........)).)))))))))...((..((((..((((.........))))..))))..))))))..((((......(((((....)).))).....))))))))..)))))))))))))).(((((....)))))......((((((((((...................(((((((..(((((..(((.((((((((.((((((((.(((((......)).).)).))))..))))))))...))))))))))))..)).)))))(((..(((((((..(((.((((..(((((((((((.(((.((((...)))).))).((((...))))..))))))))))).((((..........))))...))))...)))..))).)))))))..)))))))))).......(((((........)))))).))))..)))))))......)))))))))))))))))(((((.(((......))).)))))((((.....((((((...(((((.((((.......(((((....(((((((((....(((....((((..............)))).)))))))).))))..((((((((((((((((((..((((.((........(((((..((((.((((((...)))))))))).....))))))).))))..))))..)))))).)))))))).......)))))......)))).))))).)))))))))).....(((((....)))))...)))))))...))).))))(((((((.((((....)))))))))))..(((((((.((((((((...((((((((......))))))))...))........))).)))))))))).........(((..(((((((((((((...((..((((((..(((....)))..)))))))).)))..))))))))))..)))...........))).)))).))))).))))))))))......(((((((......)))))))....))))))))).......)))))....))))).)))))))))))))))...))))))))..((((((....))))))...(((((.((((((((((((...((((.(((((.(((..((((((((..(((((((........)))))))..))))........((((((((..........))))).))).....))))..))).)))))))))....((((((((..(((...)))..)))))..)))..........((((((.((((...(((((((......(((((.............((((((((((((.......(((((.....))))).((((.((((((.(((((((((((...................(((.......)))..(((((.((......)).)))))....((((....))))......................................)))..)))))))).......))))))..))))....)))))))))))))))))......)))))))...)))).)))))))))))))).)))).)))))...........))))).))))))))).)))..........(((((....((((((...))))))...))))).(((..(((..((((((.((((((...((((.....))))..)))))))))))).)))..)))..)))))...))))))......)))))))..))))))))))))).))))))).)))))))))))).((((...))))((((..((((.....)))).)))))))....))).)))))).))....)))))...............(((((((((........))))))))))))))).)))).((((.((((((((((((((.((((.......(((((.((((......))))...))))).((((((((((((..............)))))))))))).((((.((.(((((..((((.((((....(((...))))))).))))..))))))).))))...........))))))))))))).)))))..))))....))))))).))))))).))).))).))))))))))))))))))......(((((((((((....))))))))....)))(((........)))((((((((((((.............(((((((((((................((((.....((((((((.(((((..((((((((((......))))))...)))).)))))(((..(((((.....))))).)))((.....))....((((((.....((((..(((((((...(((((.((..((....))..)).)).))).((.((((((.....((((.....))))....)))))).)).((((((...((((((((...........((((((........)))))).((((..((..(((((.((((((......((((((....)))))).......))))))))))))))))).((.....(((.((((((((....)).)))))).))).....)).))))))))......))))))........)))))))..)))).))))))...........)))))))).)))).........))))))))))))))))))))))))).))).))))))))).)))))..))))))))))....)))).)))))))...........((((.....))))))))))).........))))))).......)))))..))))).))))).((((((((((.....((((((.........((((((......))))))))))))......))))))))))..((((((((.((((((((...............))))).....((((((....))))))))))))))))).......)))))).))))))....))))))..((......))...((((((((.......))))))))))))).)))).....((((((......))))))))))).)).....)))))..............
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((.(((((...{((((((((..,.(((((((((((((...(((.((((.(((((((((((......))))))))..))))))))))..)))),}))).)))......,((((((((.((..(((.(((((...........))))).)))...)).)))))))}...,,,...))...)))))))))......((({,(((((((,,.(((..........))).).))))))))))).....))))))))))))(((((.....((.((((({,.(((((.((((((...)))))).,})))).....,,{(,{{||.,,,.{{({({,,((((((.{{{((,,{{((((((((((((({{{{.||}|,((({{{,.,....{({.{((.....}}}.})).|}},}.|{{{{|{|}|{{,,.{{{{{||,,||||||{(,,{{{,|..,,),)))),))))}))),},}}})}}),..,...,.{{{{{(...)))))),..,,.{{||{{|{,,....,}.}||||,}}||,||,||||||,||||}|}}.{,..,.,{{{{{,,||..|,|||.,}}}}))))}}|,({{,.......||..,,|,...,,||,{,,((((,((((({(((((.(({,(((((((((.({(((((((....(.((((((((((.(({.....{{({(,,,......))))}...(((.(((((((.(,..(((((((.(...((((,(({({.,,{{....)))),..(((({{...((((.....))))....},..,..}}}}......((((((.......)))))){{{{...........)))),.)))).).))))))),(((({.....{(({.((((((...(((((......)))))...,,(((((...((.(((((((((....(((.({,...,,}||{{(((((({{{{{{,{{{{{{{.....,((,,,,,,||.....}}}}})).).)}.,{{(((.,,.....((((((((({{(,((.((.((.(((((.(((((((((((,{(({.,,......((((((((((..((.........))..)))))))))){{{..((((.(((((((((.(..(((((....(((.((({{{{.....,},..})))))}.)))))).)))))))))...))))..}))(({...}}}.,,.,|,|{|..{(({{{((.,{(({{{.....,.,}}.)))}....{(((((.......)))))}.((((...((({{{((((.(((.{((((((((((((.......)))))((.....))((((...((..(((.....)))..))...)))))))))),.}).))).)))))))))))))..||||,|||||||.,,})))})))))))},}))).)).))).)).)),,(((........)))..}))).))))))))).(((((((..(((((....{(.((((....))))}}.(((..((((((.{{........}}.))))))..)))....((((......)))))))))..)))))))..........((((.{(({....,,,}}),))}}.},,.}))}){(((({{,{{,,...((((((((((..(((.((({((((((((.{...,({..(((((.{{{(({({({,((((......)))).((((((.,,.,....{{..,,||||,.....}|||.,..||.,..|,.,,}}}})){{{{{.,.............}||||(((({......}})),...,||,.}},...}}|},....,,.,})))..)))))))....}.))))))))((((((({(((((((((((((((((.(((.{((((((,,....,))))))}{((..((((.((.((.(((((.....))))).)).))..))))..))}((.((((((({((((({,.{((,{{{{(({((,.{{((((((((((((((.....))),,)))){(((({({{{|||}},..,||{{|||||||}||{((...}},{((({....|}|||,....,||}|||,.,{{,{|||.(((((((((((|{{(((..((((({{|{...{{(({,,...,.((((((....(((((((.((....(((,.{(((((((((({.(((((..{{|.{{{,{.(((((((.((((((.......((((((((((...(((.{.,,{.{({{,...,,.))),).)))...))))))))))...,{,(,,.({{({,,(({,{{(,..,,{..{||||{|{||,.{,..,}}..}..,})))).||||........}},|}}}..,}},.)}).}...)))))).)))))))..{{(((((.((((({...}))))).........}))))}){{,.,,..,,...,}}.})}.)),..)))))((((((((.((((.(.(((((((((.....,{,.....,,....))))))))).).))))..)))))))),{{{{(((.{{,({{,,{{||||{{.....))})))))}))|}}},},||{{|{{||{(({{{{{(({,({,(,(((({.,,,..(.(((((((.((.(((.{{........}},))).)).))))))),..,))))).}.}),))).},..}))))))))|(((((((((((......(((((({((((((({......,(((((((....................)))).)))))))))))}..)))))).....(((.(((((.(((.(((.(((((......((((((....)))))))))))...........((((,...,))))..))).))).))))).))).)))))))))))}..)))))},)))))))))...)).))))))).(((((....)))))))))))..}|||,,|||}}}}}..|||}}(({{(,,{(({((.,{,,{{.,,.||||}||,,,,),)}},})||||||((,,.{.(({.(((((((.((.(((......)))))))))))).})}.}.)),,.,))))))}.((((((....))))))......|,|,,}}|...((,((((((((((((((((({{{{,..{,.,.,,..(((.,,.(((({.((((((((((.....(((((..((((.(((.,(((((.,.,|||}}}{(((.(((....))))))}........(((((........)))))(({{(((...((({{{{,,|,.,..........((((((((((((((...,,((({{...)))},...,{{{...})}}.....,.,||{(({,.(((((((..((((.(((((.((..(((((((((((((..({({{.{(((((,{.{((((({(,((((({...|}}}}},.{{({..,,|,...|||,{{,{{{{{{,,{{{..,,,}||.{({,{{,(((({....}))))..,,{|,..,{{{{{{{{{|,.||....(((,,(((..((((((......,,,,,..(((((((((((...(((((.,,,{{...(((((({{(,,....((((((.....)))))).,),}}))))))....})).)))))(((((((((.,,((((,.,....,,{((({.(({((.(((...,(((((((.(,{{{{{||.,|||||}|,....,.|{||,,...(((....(((((((({....})))))))).....)))..,|||||,,.,,}))}||((((((.......))))))||({{...}},.,.,{({{{.,,{||,|({((,{((({{{{{|||,.,,{,|,,.|,...}}},,{{((((...(((.....)))...))))}}}{{{({,.,,,}||||{{{,..{|{{....|}||,,,,||.}}}}.,,.,,{{((({,,..{((({,...|||||{{.....||||,,,.}))),,,,({{,,.}}},,.||,,(({.......}}}.}}))))}}},})))))))}.))))},|||..,|||,.((((((((((........)))))))))).||||{.,,))})),||},}|,.}}}}||,,{,|{|||||||,||{.|},||}|||}}}},,,,,.,.}}}}}}}..,}})...})}},),}}......{(((({.{{.((((..(({...,)),,))))......}))))}..)))}.....)))))))))))))))))))),||,(((((....))))),||(((((((({,{({,{..........,,,,,,..,,,.......,||||||||}}..))))|{|||{.{{(((((((...(((((..(((({...})))).(((((((((.......)))))))))))))).....))))))).}).)))}}}...))))))...)))))))}},}}}})))))},,))),..|,,,,)}..,},}},,..,|||||,,},||||.,,,,,((((((.....))))||,,,,....,},)))||||}}...},.,))),}|}.,{{{...,.,|||{,,{{(((((.{(({,{{(((,..((((((((...{({......)))......)))))))).}}}}..|}}}.||||||((,(((((((({{,,|||,.,,,...,,.((((((((.(((((((...((((((((.((((....{{(((((........)))))..}}....)))).))))))))((((..............,,,,..............,,,,....{{{{.{,{{{.{{,,,....,......}},}}})),})}},||,..{{|,|,....((((((((((.......)))))))))).....,,.}}}...............)))))))...)))))))).,,.......(((((((...))))))).{{|{|,,..,,,|||,,{{{{{{,,.,..,{{{{{,{{{{|{{,(({,(,{{{{((((,{,..,,{||||},}}}}.,|||{,,|,|||||,||,.|||},},,,,,.(((((....))))).((((((((.........)))))))).}}}||||{{|||,{|||||||{(((((,,.,,,,((((((,,(((((((....))))))){||,|}}}||,{(.{(({....}))},},.....||,,,.{{{{{{...,,,,)})})),)),..,,))))))))))))))||{,||}|||{(((((({{{,......}}||||||||||{{,,.....,..........}|||||.{{{|,||{{{|..,,,((((({....}))))}...|||},,,..,))),,,,.||||||||}}}}}}}}}||}}}}}|||||,..,,|||,...,,,(({{{{{{||{{,,..,,.{{,{,,,..,,,..|{|||,(((((((((({((......))).))))))))))..},,....,..}}})})},,)}}}))).},,..)))))).))))))))}}}}}}}}},}},,.......((.(((((...))))).)).,{{{{{{{{...,,,|||||...{{((((({...||||,.,{{{||...(((((((((.((((........)))).))))))))).....((((.....(((....))).....))))((((((((((.,,....,,))))))))))....{{{{{|,.{{{|||||||,,,...||,..}||}}}}}.....}))},))}}}.,)))},.}},((((.....(((((((...{((((........(((....))).))))}..))))))).....))))...{{{....((({...........}}}}....}}}..((((........))))}}}},,.))))))))),,,,,})))))))))))))))),.(((((((........)))))))..((((((.(((.((.(((((.((....)).))))).)).))).))))))})..)))))))))))))..)).))))...((((((((((((((...((((....{((,..,||,..,|,{({{.......(((((((.{(((......,.(((((({{{.((((((((.....{{{{{{{,,,.....(((((((,{(((((...,(((((((.{(.((((((..........))).))).,,((((((.,{{.,,....)),...))))))...}).)))}||(((((((.((((...(({{....,)))}........(((((.....)))))..((((((.....))))))..(((((((((((((((.....{{(({...........})))}...........{(((((.,.....,.)))))}.,,,....,...............)))))))))))))))),{,..(({...})),,,........)))))))))))},...(((((........)))))..))))))))))))){{{{{,{.....,,......},,...))))))}}}}......)))))))).}}}.....{{,.{((((.,,((({{..,,)))}}..(((((((......({{...((((((((,.(((....))).,))))))))}))......))))))).))))))}.)))))).,.......)))}.)))))))((((.........((((((......,(((,...,,)})}...))))))))))......(((((((({.({........)).})))))))).,,((,,((((..((((.........)))).,||}}..}})}))},||,{....,,|{{||...,)))})),,,..}},,))))..)))))))))))))).(((({....}))))......((((((((((.,...............,.(((((((..(((((..(({.((((((((.((((((((.((({(......}).},)).))))..))))))))...))))})))))))..))},))))(((..(((((((..(((.((((.,((((,(((((,..........}}})),.)))}|{({..,}}}}.,|,,||||,||,.({{,.....}..}.)))).,.))))...)))..))).)))))))..}))))))))).......(((((,......})))))).))))..)))))))}))},,}.,)))))))))))))}{{(((((.{,.......},.))))}.||,....((((((...(((((.{(((,...{{.(((((....(((((((((....(((....((((..............)))).)))))))).))))..((((((((((((((((((..((((.((,..{{{{({,,,|}}|||.,((((({...})))))||||.....,))))}).))))..))}})})))))))}})))))).......)))))..,,,,)))),))))).)))))),},}.....(((({....)))))...}}}}}))...))),))))(((((((.((((....)))))))))))..(((((((...,{,.,,...((((((((......))))))))...,|((((,...)))))).))))))).....,...(((..(((((((((((((...,(..((((((..(((....)))..)))))),),)))..))))))))))..))).,,,.....,.))).)))).))))).))))))))))}......,{{{{,......}}}}|((((.{{({{.{{{(((....))).}))})))))))})))),,)))}}.,||||((((({..{,.((((((....)))))),)),)))))).,.})))))))))))))))}.}}..,,},|||{.((((..(((((((........)))))))..))))..}}},..}))))),,)))))...})))))))))}).((({.(((((.{.{{(({({(((...(((((((((,,(((((............))))}...,,.))))))}})).,.))))),)})}.}))))).})))......{{{{{{.,{{{{{{(((({|,|,,,.,||,},,},))})),,,,})))}..,})))))}}}}}}.........})))})),..,|,,,..,}}),...(((((.((......)).))))).,{{((({....))),..,.................,,..,,.}}}}}},{{{{|{|,|,,..........||,{({{{..........})}}},....}}},,,|{,,|...,))))},,}})}))}}}))))))).))..{|{{.....}}}}.........))))).))))))))).}}}..........(((((....((((((...))))))...))))}.,{{..(((..((((((.((((((...((((.....))))..)))))))))))).)))..}},..,}}}},.,))))))......}))))))..)))))))))),,,.))))))),)}}}}))))))),|||,...,,,,((((..((((.....)))).)))))))....))),,))))).))....)))))..,,....,......(((((((((........))))))))))))))).}))}.((((.((((((((((((((.((({.......(((((.((((......))))...))))).((((((((((((,,,....,})}...}})))))))))).{(((.((.(((({..,{{({((({{,{.(((...))).))),))))|.})))))).)))}...........))))))))))))).)))))..))))....))))))).))))))).))).})).))))))))))})))}}}){{((((.(({..,|||.}})))),.}},|{{{{||,(((........))),{{(((((((,,....}}}},,...{((((((((((....,,,.........,,,.....,(({(((((,(({{{..{{{{((((((......))))))...}}}}.}}}}}(((..(((((.....))))).)))|,..,,,}},,,.{{{{{{.....{{{{..{{{||{|..,||(((.{(,,{(....))}.)).})}}}|,((.{((((({{...((((.....)))).,,,}))))}.}}.((((({,{{(((((((({{,...,,,{.((((((........)))))).((({..((..{((((.{(((((......{(((((....}))))).......))))))))))))))))).{{...,,....{((((({(....}}.)))))}}))}.,.}}}..))))))))....},))))))...,|,,.}))}}}}..)))).}))))}.........,,}}}}}}}),}}}}}}..,}}}.))))))))))),,))))))),}})).))).))))))))).))))),,|}}})))}},.{{{{|||{||||.{{{........|,|{{{.,,,,))))))))}||||||||,,....{{{,,..}}}}}}}}},,...}))}))}},({{{{{|{((,,,..{{{{{{,........((((((......))))))}})}}}..,{{,|||||||}}}..{{{||{|{,|,{((({{..,,,.....,,,,}}))))....|((((({....}))))))})))))))))},,......}})))))))))),.}}},}.,..}}}},,,,}.,|||{((((((..,....,)))))))))),,.,||},,,},{(((((......))))))))))).)).....)))))..............
Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001321887.2 | GAAGAGAGGCACAGACACAGAUAGGAGAAGGGCACCGGCUGGAGCCACU… | 4298 nt | 0.3906 |
| NM_001321888.2 | GAAGAGAGGCACAGACACAGAUAGGAGAAGGGCACCGGCUGGAGCCACU… | 4098 nt | 0.3890 |
| NM_001321889.2 | GAAGAGAGGCACAGACACAGAUAGGAGAAGGGCACCGGCUGGAGCCACU… | 4335 nt | 0.3882 |
| NM_001321890.2 | GAAGAGAGGCACAGACACAGAUAGGAGAAGGGCACCGGCUGGAGCCACU… | 4399 nt | 0.3933 |
| NM_001321891.2 | GAAGAGAGGCACAGACACAGAUAGGAGAAGGGCACCGGCUGGAGCCACU… | 4273 nt | 0.3901 |
| NM_001321893.2 | GAAGAGAGGCACAGACACAGAUAGGAGAAGGGCACCGGCUGGAGCCACU… | 4170 nt | 0.3904 |
| NM_001321894.2 | GAAGAGAGGCACAGACACAGAUAGGAGAAGGGCACCGGCUGGAGCCACU… | 4179 nt | 0.3905 |
| NM_001321895.2 | GAAGAGAGGCACAGACACAGAUAGGAGAAGGGCACCGGCUGGAGCCACU… | 4113 nt | 0.3893 |
| NM_001321896.2 | AGAAGGACUGAGCUAGUUUGCGAAACCACAGCACACUUUGGCAAAGAGG… | 4265 nt | 0.3885 |
| NM_001321897.2 | GAAGAGAGGCACAGACACAGAUAGGAGAAGGGCACCGGCUGGAGCCACU… | 9645 nt | 0.4009 |
Showing 21 to 30 of 40 entries
Summary
Histones play a critical role in transcriptional regulation, cell cycle progression, and developmental events. Histone acetylation/deacetylation alters chromosome structure and affects transcription factor access to DNA. The protein encoded by this gene has sequence homology to members of the histone deacetylase family. This gene is orthologous to the Xenopus and mouse MITR genes. The MITR protein lacks the histone deacetylase catalytic domain. It represses MEF2 activity through recruitment of multicomponent corepressor complexes that include CtBP and HDACs. This encoded protein may play a role in hematopoiesis. Multiple alternatively spliced transcripts have been described for this gene but the full-length nature of some of them has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
