Basic Information
Symbol
HDAC9
RNA Class
mRNA
Alias
histone deacetylase 9
KIAA0744
HDAC
MITR
HD7
HDAC7B
ARCND4
HD7b
HD9
HDAC7
HDAC9B
HDAC9FL
HDRP
MEF-2 interacting transcription repressor (MITR) protein
histone deacetylase 4/5-related protein
histone deacetylase 7B
Histone deacetylase 9
Histone deacetylase 7B
Histone deacetylase-related protein
MEF2-interacting transcription repressor MITR
EC 3.5.1.98
Location (GRCh38)
7:18086949-19002416
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_178425.4
Sequence length
9880 nt
GC Content
0.4020
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2622 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-2812.67 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
2632.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
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Showing 31 to 40 of 40 entries
Summary
Histones play a critical role in transcriptional regulation, cell cycle progression, and developmental events. Histone acetylation/deacetylation alters chromosome structure and affects transcription factor access to DNA. The protein encoded by this gene has sequence homology to members of the histone deacetylase family. This gene is orthologous to the Xenopus and mouse MITR genes. The MITR protein lacks the histone deacetylase catalytic domain. It represses MEF2 activity through recruitment of multicomponent corepressor complexes that include CtBP and HDACs. This encoded protein may play a role in hematopoiesis. Multiple alternatively spliced transcripts have been described for this gene but the full-length nature of some of them has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
