Basic Information

Symbol
HECTD1
RNA Class
mRNA
Alias
HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1 KIAA1131 HECT domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 EULIR E3 ubiquitin-protein ligase HECTD1 E3 ligase for inhibin receptor HECT domain-containing protein 1 HECT-type E3 ubiquitin transferase HECTD1 EC 2.3.2.26
Location (GRCh38)
14:31100115-31208381 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001411010.1
BLAST PRIMER
NM_015382.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_015382.4
Sequence length
9445 nt
GC Content
0.4442

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2849.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -3033.18 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2098.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001411010.1 GCCUCCGCCGGGCUCGGCUGCCCUCGGCAGCUUCCCCGCCUGGCUCUCC… 8929 nt 0.4311
NM_015382.4 GCCUCCGCCGGGCUCGGCUGCCCUCGGCAGCUUCCCCGCCUGGCUCUCC… 9445 nt 0.4442
Summary

Enables ubiquitin protein ligase activity. Predicted to be involved in positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; and protein K63-linked ubiquitination. Predicted to act upstream of or within several processes, including chordate embryonic development; circulatory system development; and protein autoubiquitination. Predicted to be active in nuclear speck. [provided by Alliance of Genome Resources, Nov 2024]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image