Basic Information
Symbol
HERC1
RNA Class
mRNA
Alias
HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1
p532
p619
hect (homologous to the E6-AP (UBE3A) carboxyl terminus) domain and RCC1 (CHC1)-like domain (RLD) 1
MDFPMR
probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1
HECT domain and RCC1-like domain-containing protein 1
HECT-type E3 ubiquitin transferase HERC1
guanine nucleotide exchange factor p532
Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1
EC 2.3.2.26
EC 6.3.2
Location (GRCh38)
15:63608618-63833948
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_003922.4
Sequence length
15197 nt
GC Content
0.4708
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4958 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-5227.68 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
4068.91
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_003922.4 | GUCUUUCCCUUUGACAAGUCGCUGCUGCUGCAGCAAAAAUAAAGGACGC… | 15197 nt | 0.4708 |
Summary
This gen encodes a member of the HERC protein family. This protein stimulates guanine nucleotide exchange on ARF1 and Rab proteins. This protein may be involved in membrane transport processes. [provided by RefSeq, Mar 2012]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
