Basic Information
Symbol
HIPK2
RNA Class
mRNA
Alias
homeodomain interacting protein kinase 2
homeodomain-interacting protein kinase 2
PRO0593
hHIPk2
Homeodomain-interacting protein kinase 2
EC 2.7.11.1
Location (GRCh38)
7:139561570-139777998
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_022740.5
Sequence length
15329 nt
GC Content
0.4983
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-5100.34 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-5377.46 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
3648.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001113239.3 | AUGCUGAGCUGAGCCCCGCCGGCCCUGGCCGCGCGCUGCCCCCGGCUCC… | 15248 nt | 0.4984 |
| NM_022740.5 | AUGCUGAGCUGAGCCCCGCCGGCCCUGGCCGCGCGCUGCCCCCGGCUCC… | 15329 nt | 0.4983 |
Summary
This gene encodes a conserved serine/threonine kinase that is a member of the homeodomain-interacting protein kinase family. The encoded protein interacts with homeodomain transcription factors and many other transcription factors such as p53, and can function as both a corepressor and a coactivator depending on the transcription factor and its subcellular localization. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2011]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
