Basic Information

Symbol
HIPK2
RNA Class
mRNA
Alias
homeodomain interacting protein kinase 2 homeodomain-interacting protein kinase 2 PRO0593 hHIPk2 Homeodomain-interacting protein kinase 2 EC 2.7.11.1

Secondary Structure

MANE Select
NM_022740.5
Sequence length
15329 nt
GC Content
0.4983

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-5100.34 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -5377.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3648.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((.(((((..(((((.((((((.((((((((....(((((((((..((((......))))....)).)))))))))))))))((((((((...((((..((((((((((((.((((.(((((((((.((((((.((((.(.((.....)).).)))).)))..)))..))).)))))).).))))))))(((((((((((.((((((..(((....)))..)))))).)))....)))))))))))))))..))))))))))))(((((((...(..(((......))).).))))).))..)))))).)))))..))))))).((((((..((((.((((((..(((((..(((.((.((((...((((.....))))...)))).))..))))))))..)...........((((((((((.......((....(((.((..((((........))))..)))))....))((.((.(((((....))))).)).)).(((..((((.(.((((....((((...((....))....))))....)))).).)))).)))..((((..(((((....((((((((.(((.....))).........((((((((..(((((.((....(((.((.....))))).....)))))))..))).((..((((..((((.(((.(((((......)))))..))).((.((......)).)).))))..))))..))...(((((..((............))..))))).))))).))))))))...(((((((((((((((.((((((((((.(.((........)))))))))........)))).))((((((.((((...................................)))).))))))...(((((((((....(((((..((((((((((...))))))))))....((((...........))))...(((..((.((((.(((((.((...((((..((((((..(((((((((.((((((.((.(((((...((((.((((...............(((.(.(((..(((.((((..((((((..((.......))..))))))..)))).))).)))).)))..)))).))))...)))))..)))))).....)).)))))))))..).)))))....(((((..((((((((.(((((((......))))..))))))).)))).....)))))...))))..)).)))))..........))))))..)))...((((..((....)))))).((((((((.((((((.(((((...........)))))...(((((...........)))))(((....))).......((((((((..((.((......(((((((..((..(((((..........)))))..))..))........(((((((((......((((...))))((((((....))))))(((((..(((.((....)).))).)))))..))))))))).(((((((((((..((((((((((..........))))))))))...((.((.((((...((((((((.......(((((.....)))))..))))))))....)))).)).))((((((..((((((((((.((((((.((((...))))......((((.....))))((((.(((.(.....((((((((.((..(.(((((..(((.(((.((((....(((((.((((......))))...)))))...)))).))))))((((((..(((((......(((((.(((((((.((..((((((((......)).))))))..((((((((.((.(.((((((...(((((((((...((.(((((....(((((((.......(((......)))..........(((((...))))).........)))))))....)))))))...)))....((.(((((((.....))))))).))..))))))((((((((((((((((...(((.............)))....)))).))((((((((..(((((((((((((...(((((((..((((((((((.........(((....)))........((((((((((((.......((...((((((((((.(((((...(((((((...................(((((((((((.((((((((((((.(((.((.((((((.(((...((...))..))).)))))).)))))...)))(((((.......((((((((.(((((((.(.(((((((((((.....((((.((((.(((((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((((((..((((.......))))..))).))))..))))(((((((....(((((((.((.((((((((((((((((..((((...(((...)))...))))....))))))))(((.((((((((((.(((((((.(((((.((..((((....)))).)))))))...)).)))))((((((..((..((.((((((.((((........((((((((.((((((((((.(((.(((((..(((((...(((((..((..((((((((....)))))....)))..))...)))))..))))).......((((((((......((((((((((...(((((((...(((((((..(((((....((((((...((((((((((.......(((....))).((((....)))).......(((((((.(((((..((.((.(((.(((......))))))....)).))...)))))...)))))))...(((((((......))))))).((((.((((((((.((....))...)))))))).))))...((((((((((((......((((((.(((((..(....)..))))).))))))...((((((...((.(((((((.((..((((.....(((((((..((((..(((.((((((((((...................)))).)))...............(((....(((((...)))))....)))))).)))..))))....(((((((..(((.((......))..)))(((((...)))))((((......))))..(.((((((....)))))).)).))))))..))))))).(((((...)))))....(((((..(.(((((((((......)))).............))))))..)))))....(((((........)))))(((.((((((((((((((..........((((((.......((((((.(.....).)))))).....(((((((((.....))))..)).))).(((((.......)))))((((((.(((((.(((((.(((((........((((((((((((....)))........(((((((((..((((((.......((((.....))))......)))))).....))...)).)))))..........(((((...(((........)))..)))))........))))))).))..))))).)))))...(((((((.(((.(((((................((((..(((.(((.(((((..(((.......))))))))...))).))).))))((((.(((((((......)))))))......)))).....((((((...((((((..((((((.(.((((....((((((...((((...(((.(((.((.(((.(.((.((((...(((..(((..((((.....))))............((((.((..(((((.((.((((.(((((..(((...((.((...)))).)))...)))))..................)))))))))))..))))))..)))..))).....)))).)).)))))).))).))).))))))).)))))))).))))))))))))))))))((((......)))).....(((.........)))....)))))..))).)))))))))))))))))).)))))))))))))))))).)))))....)))).))))).))))))...))))))......(((((((((((((((((((((...(((...((((((...(.((((((((..((((.(((...(((((((((((.((((((((((((.(((((((...............((((...((((((((..((.(((((..(((((..(((.((((.(((((...(((....)))......(((....)))((((((((((((...........))))))))))))....((((.((....)).)))).....(((((((((((((((....)))))))((((((((.....)))))))).....(((((((((((.(((((((((((.((((((.((((((((((..(((.(((((((((....((((((..((((((....))))))..))))))..))))....(((((((......)))))))(.((((((..(((......)))(((((.(..((((....))))..).))))))))))).))))))..)))..))))))).)))...)))))).)))))))))))..((((((((..............))))))))((((((((..(((((((...(((((......))))).........(((.(((....(((.((((((.(........))))))).)))..))).)))...))))).))..))))))))...(((....))).......)))))))))))...................((((.(((..((((.(((((..........)))))...))))))).)))).......((((((((((.(((.((((((.(((.(.((.((((((......))))))..))))))))))))..)))....))))))))))((.....)).)))))))).....))).))))))))).)))))..........(((.....)))))))))))))))..)))...))))..............(((((((((.((((((((((.((((......)))).)..)))))....))))..))))))))).))))))).))))))))))))))))))))))).....))).((((.(((((((((..(.(((.(....).))).)..))))))))).)))).((((((((((((((((..(((((..((....)).....(((((...(((....((.((((((((((((.(..(((((((((((((...((((.(.(((((..((.(((((....(((.(((((....))))).))))))))..........))..)))))).))))..)))).......(((....((((((((((.((((....)))).))))))))))..))).)))))))))..).)))))).))))))))..))).)))))...)))))((((((.....))))))((((((....))))))..))))))))))..)))))).((((((((((((((......(((((((((((....(((((..(((((...((.(((((((((((((((((..((((((((......((..(((((.((((.....)))).)).....)))..))......)))))))))))))))))).))))))).))........((.((((((..((((((((....(((..(((((((((...(((......))).)))))))))....((((((((.((((((((((.((((((.(.......).))))....((.((((((.((((.....(((((((((.((((.((.(((((..((((((...((..(((((((((.......(((..(((.((((..(((((.((.(((.((....((...((((((((((((....(((.((.(((..(((((((..((((.(((.(.(((.......))).).)))..))))....)))...))))..))).))..))).......))))))))))))...))))))))).)))))....))))))).)))..(((.....)))..)))))))))(((((((((......)))))...)))).....(((((((....)))))))(((((...))))).))...))))))....))))))))))))).........(((((.......)))))....)))))))..(((....)))....)))))))))).))((((..((((((............((((.((((((((((((((.(((((.(.........).)))))...)))))))))(((.....)))..))))).))))....))))))))))(((((((.((....(((((((.....(((((((.(....).))..))))))))))))...)).))))))).)).)))))))))))))))))).....(((((..........)))))))).))))))))..))))))))..((((...)))).((((...))))))))).)))))...)))))))...))))))))).))))))))).))))))))))))).))))))..((((((((((.((((((((....((((.((.....)).))))...(((((....)))))....)))))))).)))))(((((((((........))))))))).)))))..))))))))))))))))).......((((.....)))).)))))))..)))))))))))))))))))))).(((((((.((((.(((((.....(((...)))..))))).)))).(((((..(((((((((((((((........(((.........((((..(((.(((........((((......))))........))))))..))))........)))......))))))))))...................((((((.......)))))).....)))))..)))))((((((....)))))).....)))))))........(((((((..((....((((((.(((....(.((((((.(.(((((.........))))).).).))))).).........((((....)))).........(((((((((.....)))))).)))......(((((((.((..((..(..(((((((((((.((((((((.((((((((.((.....)).)))))))).(((((...(((..((((......))))..))))))))..((((((..........(((...(((((((........)).)))))....)))...........)))))).)))))))).)))).....)))))))..)..))..)))))))))...)))))))))......))..))))))).(((.((((....((((((.(.(((....((((((......))))))....))).).))))))..)))).))).(((((.((((.((((...(((.((((((...(((((...((((...)))).....))))).....)))))).)))....)))).))))...)))))..((.((..(((..((((((.((((((....)))))).))))))..))).)))))))))).(((.......)))......)))))..)))))))...))))))).))))))))))((((((((.......(((((((.(.(..((..((.((((((((((((((((((.((((..((((.(((.....((.((((((((((((.....(.((((.(((((...........)))))....)))))..((((.((........))))))))..)).))))).))))).)))))))..).))).))))).....))))))))(((((((((.((((((((((.(((((((.(((.......((((.((((((.......................)))))).))))))))))))))..((((((((.((((((..((((((((((((((((((.......(((..(((........)))..)))...((((((......(((((.....))))).......)))))).........(((((((((....((((((....))))))...)))))))))(((((.(((((..((((((.(.....).))))))))))).))))))))))))....)))))))((.((((((((.....)))((((((((((((...((((((((...))).)))))))))))))))))....((((((((.((((((((....))))))))..).))...)))))))))).)))))).))))..)).))).)))))..))))))).........))).)))))))))...(((.....)))(((....))).)))))))..))..).).)))))))..))))))))......)))))))))))))..)))..)))..))))).)).)))))))).......)))).))..))))))..))...)))))))))))))))).)))((..(((.((((((((((......)))))......((((.((.((......)).)).).)))..)))))..)))..))...((((((((((((......)))........))))))))))))))))).)).))))..))).....)))...)))).....)))))))).)).)))....)))).)))))))..........((((.......)))).))))))).)))).))))...))))))..)))))).)))..........)))).))).)))))((((((.(((.(((((....((((......))))....))))).))))))))))))))..)))))))))..)))))))))))((.(((.(((((((((((((((((..(((....((((((.(......(((..((((((((....((((((.(((((........))))).))))))............)))))))).....)))))))))))))..)))).)))))))))))))...)))))..(((((((.((((....((((((...((((((..........)))))))))))).....)))).)))))))..)))))))..((((((((((((.((...(((((((((((((((((((.(((.....(((((((((((((.(((.........((((((....))))))..............(((((((....))))......))).))))))....))))))))))....))).)))))).....((((((((((.....((.(((((((((((((((((....((((((((....)))))))).((((.............))))((((((((...))))))))((((.....))))((((((....)).)))))))))...((((...))))....((((((((((........)))))..))))))))))))).))))))(((((......)))))))))))))))((((.(.((((((.(((((((((((((((((....(((((..(((((((((((((....))))).((((.((((((....(((..(.((((((((((......((((((....)).))))(((((.((.(((((((((((((......(((((((((((((..(((.((.(((((((.((((.(((.((.((((((((((.........).))))))))).))........(((...(((((......))))).)))((.((((((((.(((((((....(.((((((((((.(........)))))).))))).).(((((((......(((((((.(.(((.(........).))).).))))...))).......)))))))(((.((..((((((((((..(((((......)))))......((((((((((((....((((((............))))))..(((((.........((((....)))).........))))).(((((((.((((......)))))))))))..........((((...))))(((((.......)))))....)))))))))))).......)))...))))))))).))).))).)))).))))))))...))))).))))))))))).))))))))))...))))))))((.(((((.....)))))))...((((...))))....(((((....(((((..(((((.((.(((((.(((((....))))).......((((.......))))........))))).))...)))))..))))).....)))))))))))))))))).)))))))((((((((......(((..................)))..((...(((((((((((...........(((((((.((((.((((((......)))))).)).(((((.......)))))(((((..(((((....(((((((..(((((((.(((.(.((((......)))).).))))))..((((.((((.(((((((...))))))).((((((..((((((.(........).)).)))).)))))).....))))..)))))))).............((((((((...))))))))(((((......)))))..((((.((......)).))))...((((((....((((....)))).)))))).........(((((((....))))))).....(((((((((((((...((((...((((((.......))))))..))))....))))))).))))))..(((.(((........((((..(((...........))).))))....))))))))))))))))))..)))))......)).))))))))))))))))))..))....))))))))..........................)))))))))).)...))).(((((((.(((((..........))))).)))))))..........))))))))))))))))))((((((((((.((((((((....((((....))))(((((((......)))))))(((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((..(((((......(((((((..(((((.(((....))).)))))((((((...(((((..((................(((((.(((..(((((.(((((.....(((((.(((..((((....((((((((((((.....((..((((....))))..))...))))))))))))))))..))).).))))))))))))))...))).)))))(.(((((((..(((((..((..((((((.(((...((((((((.....((((((((((....))))))))))..((((((((((............))))).)))))((((((((......))))))))(((((.(((((.........))))).)))))((((((((((........)))))))))).....(((((..(((((.....)))))..))))).....))))))))..))).))))))..)).)))))(((((((((.....(((.((((((..((((.......)))).........)).)))).))).....)))))))))...((((.....))))....))))))).)..((((((((((.(((.((((....((.......(((((((..........(((((((.......)))))))..))))))).......))....))))))).)))...)))))))............))..))))).....)))))))))))))..(((((((((.(((((......(((((..((((((((((((.(((((((((((.((...(((.........)))..)))))))))))))..))))...))))))))))))))))))..(((((((...)))))))..((((.......))))..(((........)))...((((((.....)))))).(((((.(((((..(((...(.((..(((((((.((((((((..(((..((....)).(((((.((((((((....(((((...(((...((....)).))))))))..)))))))).))))).....(((((..(((((.....)))))((((.(.((((((((...((((((.......))))..)).....)))))))).))))).........((((((((.((((..(((.....))).)))).)))))))).....((((((((((.......))))..))))))..(((.....)))))))).)))..)))))))).))))))).)).)...(((.(((((((....)))..))))))))))))))).))))))))))).))).....(((((((...........)))))))...)))))..)))))))))((((((....(((((((.(((((..........(((((((............((((((((........))))))))...(((((((...((((.(((((...)))))))))))))))))))))))....(((((((((((((...((((...(((...(((((((((((((..(((((.(((((...(((.(((((((......)))....(((....((.((((...(((......))).))))))...)))))))..)))))))).)))))....(((((((((((.((((((.......)))))).)))))..))))))....))))))))))))))))...))))..))).))))))..))))))))).((((((.....))))))))))))).......))))))...........(((((.((((((((..............................))....))))))....((((....)))).((((..((((((.........(((((((((..(........)..))))))))).......))))))..))))))))).)))))))))))))))))..))))))))))))))))))))...........((((.....)))).))).)))))))((((((....(((((((.....))))))).(((((((.((((..((....((....))....))..)))))))))))......((((((.((((...(((((((((((((.....((((((((.((.....((((((((.(((((((........(((........)))((((((..(((((.(((...(.((((.((......(.((((((........)))))).).....)).)))).).))).)))..))..)))))).((((....))))...((((....)))).(((.(.(((......)))).)))..)))))))...)))..))))).....))..))))))))....))))))))))))).....))))))))))..........((((.(......).)))).((((.((((..(........)..)))).)))).............))))))......((.((((....)))).))))))).)))))))...))).)))))))...)))))).).)))))))).)..)))))))).)).))))))).)))))(((...))).((((..((......)).))))....(((((((((....((((...(((((.((((((((.................)))))))))))))...))))..((((...(((((......)))))...))))..)))))).))).((((((((((((......)))))))))))).....))))).)))).))))))..)).........))))))..))))))..))))))))))..)))).....)))....))))))))).))))(((.((.(((.(((.(.((.((....)).))..).))).))).)))))(((((((((((((((..((((.(.((((.(((....))).)))).))))).(((.(((......((((...)))).....))))))...)))))))))))))))......((((((((((.(((........))).)))..)))))))))))))))......((((((..(((.((.((((.((.....(((...(((((...))))).)))..)).)))).))))).))))))..)))))))))))))))).).)))))))))).((((.((((.........(((.((((((............)))..))))))....(((........))).)))))))).......)).)))))))..)))))))))).)))))).......)))))).))))))))))...)))).))))..........)))))).)))))).)))).))))))...(((....)))))))))))))))))))......)).))....))))))))...........(((((..((......))..))))).............(((((.(((((.((((...((((((((...((((((.((((((((....))))))))..........))))))..(((((....(((.....)))...)))))))))))))......))))..))))).)))))..)))))).))..)))))).(((((......)))))..)))))...))))))))).......))))))))))))).....)))))...))))((((((.(((.....(((((....(((((..((...((((((((((((((((.......)))))).........))))))))))...))..)))))...)))))))).))))))..((((((((...((((......)))).))))))))))).))))))).))))).)))).......))))))........(((((...(((.(..(((((((........((((((((((((...)))))..)))))))......................((((((((((((...)))))))))).)).((((((((..((........))..)))))))))))))))..).)))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,((.(((((..(((((.((((((,{(((((((....(((((((((..((((......))))....)).))))))))))))))}((((((((...((((..(((((((((({{{((((.(((((((((.((((({.((((,(.((,....},.}.)))).)))).)))..))).)))))).).))))))))(((((((((((.((((((..(((....)))..)))))).)))....)))))))))))))))..))))))))))))(((((((...,..(({......))).,.))))).)),.)))))).)))))..))))))}}((((((..{(((.(((((,{.(((((,.{((.((.{(((...((((.....))))...)))}.))..))))))))..,.,.........{((((((((((.{{{,.{,....{(,{((..((((........))))..))))}.....,,{,({,(((((....})))}.}},}|||||..((((.(.((((....((((.,.((....))....))))....)))).).)))).,}}..{{{,..(((((....{(((((((.(((.....,}}...,.....((((((((..((((({,(,...(((.((.....)))))...,,,))))))..))).((..((((..((((.({(.(((((......))))).,))}.{{.,,......}).)}.))))..))))..))...(((((..{(,{{.......)}))..))))).))))).)))))))),,.(((((((((((((((.((((((((((.(.((,...,,}.,},))))))........)))).))((((((.((((.,.....|,......,.....,}............)))).))))))...(((((((((....(((((..((((((,{(,{{{|||||||{{|{...((((...........))))...|||,.(({((((.((({{.(({,.((((..(((((...,(((((((({(,((((..,.,{({(.{{((((,{.(({,.{{{.||{,{..,(({.{.(((..(((,({{{..||{{{{..{{....,,,||,.}}||||,,|}}|.|||,}}},.)))|,|||{{........))))),)))))},,),.}}}))|}|||||..|..}}},..},|||||}}|||||,||}|||||{|,,,...,}}},.}),,)))}}}}|,....||||,...,,,,,})),,,}}}..........)))),)}}.))}}}}},,,,}}}}}.)))),|}||...,}}....},|||||{,....,{{,,,.||}}},..,{{,{,.....|,,.|||||||||,..,,,,,}.....{{{{{{((,,((,(({,...}|||||||,,|,,{(((((..........))))).}}),}}}}}}....,(((((((((......((((...}})){(((((....|}}}}|(({{{..{{{,||.,..}).))).)))))..))))))))),{((((((((((..((((((((((..........))))))))))...((,((,({((,..{{{{||||,,,,,,.{{{{{..,,,)}}}},,))}))}}}....})}}.)).}}((((((..((((((((((.((((((.((((...)))).....,((((.....))))((((.(({,(.,...((((((((.((..(.(((((..(((.(((.((((....(((((.((((,....,))))...)))))...)))).))))))((((((..(((((......,,,((.(((((((.((.,((((((((......)),})))))}.(((((((,{((.(.((((((...(((((((((...((.(((((....(((((((.......{{{......,}}..........(((({...})))).........)))))))....)))))))...))),...{{.(((((((.....))))))).}}..})))))((((((((((.,...{,{,((((,..,{({(,,,,,{..|,}}|}||{|((((((((,,((((((((((((({{{..(((((..((((((((((......,..{{{..,,)}}.......,((((((((((((.....{,((.,,({((((((({.(((((,,,{{{((((,................,((((((((((((.((((((((((((.(((.((.((((((.(((...((...))..))).)))))).)))))...)))(((((.......((((((((.(((((((.{.(((({((({((.,.{.((((.((((.(((((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((((((.,((({.......))}).,))).))))..))))(({{(((....((({(((.((.((((((({((((((((.,((((...(((...)))...))))....))))))))(((,{(((((((((.(((((((.{((((,((,.((((....}))).)}))))).},)}.)))))((((((..,({..,.,{,,||.,{(({{{{{{{.(((((,(({(((((((....,((.(((({..(((((...,,,,...,{..{{{(((((....)))))....))}..||{,..,,)),,))))),,,,,,.((((((((......((((((((((...(((((((...(((((((..(((((....(((((,...(((((((((({,,({,.{{{....,||.((((....}))),,,,,{.(((((((.(((({..((.((.,{{.(((......)))}}}....)).))...}))))...)))))))...{((((((....,.))))))}.((((.((((((((.((....))...)))))))).))))...((((((((((((......((((((.(((((..,....)..))))).))))))...((((((...((.(((((((.((..((((.....(((((((..((((..(((.((((({{{{(......{{........}}.}|||.}}}..,,...........{{{....{||{{...)))))....}})))).)))..))))....(((((((..,.,.{{{..,,.||..}}}{{|{|,.,}))))((((......))))..{.((((((....)))))).}},})))))..))))))).(((((...)))))..({(((({{{(,{,...((((......))))...}}},.....}))))).{,||||,.,.{(((((........)))))|||.{{((((((((((((..........((((((.......((((((.{.....}.)))))).....(((((((((.....))))..)).))).(((((.......)))))((((((.,,,{{.(((((.(((((........,,({((((((({..,,|||.,......,((({,{({.{((((((.....,.((((.....)))).,....)))))),,.||||...||||,}||..........{{{{,..,|||...,,,,.))}..}))))....,...})))))).)),.))))).))))),{.(((((((.(((.(((((................{(((,,(((,(((.(((({,.{{|,|,..,,))))))))...))),))).))}}((((.{((((((......})))))),,....)))).....((((((...((((((..((((((.(.((((....((((((...((((...(((.(((.((.(((.(.((.((((...(((..(((...,{{,....,,|,.........,,.((((.((..(((((.((.{({,.({(((..{{{,..((.{(...}}}}.))}...}}}||.....,............))),)))))))..))))))..)))..))).....)))).)).)))))).))).))).))))))).)))))))).))))))))))))))))))((((......))))..,,,{(,.........}))....))))).})))})))))))))))))))))).)))))))))))))))))).)))}}....)))).})))),,)))))...))))))...,,.(((((((((((((((((((((....{({,.((((({...(.((((((({..((((.(((.,.((((((((((((((((((((((((,((((({,...............((((...,,((((((..{{.(((((..{{(((.,(((.((((.(((({...(((,,..|||{{{{{{(((....))),|||||||{{{{.|,.,.,|,..}}}}}}}})}},...,|||{,{{|,.,|,.|||},..,.(((((((((((((((....)))))))((((((((.....)))))))).....{((((((((((.{((((((((((.((((((.((((((((((..(((.(((((((((....((((((..((((((....))))))..))))))..))))....(((((((......)))))))(.((((((..(((......)))(((((.(..((((....))))..).))))))))))).))))))..)))..))))))).)))...)))))).))))))))))}..((((({{{.....,,,,,....}}}}}}|}((((((((..((,{{{{,..{((((......))))}......{{{.....|}}...|{({(((,,({(...}}}}})))||||.|||.{{|...)))}}))))).}}..)))))))).,,{{,....})}.......))))))))))}.......,....,,...,.((((.(((..((((.(((((..........)))))...))))))).)))).......(((((((((({(({.((((((.(((((.((.((((((....,))))).))))).}))))))))..)))}}..)))))))))),|....,)).))))))))..,,,))).}}))))))),))}}).,,,......(((.....)))))))))))))))}.,},...}|||....,,,.,,,...(((((((((,(({(((((,..((({......}}}),)))),,}}....))))..))))))))),))))))).)))))))))))))))))))))))...,.))).((((.(((((((((..(.(((.(....).))).)..))))))))).)))).((((((((((((((((..(((((,,({...,))....{(((((...(((....((.((((((((((((.(.{(((((((((((((...((((.(.(((((..((.((({{,...(((.(((((....))))).))),}),,...,...,,.))..)))))},))))..)))).......(((....((((((((({.((((....)))).})))))))))..))).)))))),))}}}.))))))}})))))))..))).)))))}..)))))|(((((.....)))))}{(((((....))))))..))))))))))..)))))).((((((((,,(((({{,.{.,,{((((((((....(((((..(((((...((.(((((((((((((((((..((((((((......((..(((.({((((,....,},),.)}}}}.)))..))......)))))))))))))))))),,)))))).)),.......((.((((((..((((((((....,{{..(((((((((,,,({,...,,,)}}.)))))))))....((((((({{((((((((((.(({{{{{(.....,,,,}}}}...,{{.(((({{{((((.....(((((((((.((((,((.({{(({((((({{,|,,,..{(((,(((.....}}}.||,,{{{.((((..(((((.((.(((.((....((...((((((((((((....(((.((.(((..((((,{({{((((.(((.(.(((.......))).).)))..)))}....,,},,.))))..))).))..))).......))))))))))))...))))))))),)))))....))))}}}{{(((.(((.....)))...)))))},.(((({(({{......})))}.,.))))...,.(((((((....))))))),{(({...})))},|,....,},},,,..))))))))))})),.||.....{((((.......))))}...,)))))))..(((....)))....)))))))))).,,((((..((((((.,.{{..(,{({((((.{(((({{{{||||{,|||||,|.||....},)||||||,.,|||}}}}}}|||,...}))),.))))).)),,....))))))))))(((((((.((....(((((((.....(({({((.(....).)).,))}}})))))))...)).))))))).)).)))))))))))))))))).....(((((........}.)))))},).))))))))..)))))))}..((((...)))).((((...))))))))).)))))...)))))))}...),))),)))))))))))).))))))))))))}.})))))..,||||(((((.((((((((....((((.((.....)).))))...(((((....)))))....)))))))).)))))(((((({{{.,,,....})))))})),)))}}...}})))))))))))))).......{{{{.....}))),))))))}..))))))))))))}))))))))).(((((({.{(((.{((((...,,({{...,}}..))))).)))}.,{(((.,{(({{{(((((((((((,,,,..{,,...|||||,|||||.{{,.,,|,,,..|,,{{{{......))))......,|||||||..||||,{{,,|..||,.....,}}}|||))))|.,,,,.,.......,,,.((((((.,.,...}})))}..,,,))))}.,})))}((((((....)))))).....})))}}),.......{((((((..((....((((((.(((....(.((((((.(.(((((.........))))).).),,)))).},........{(((....)))).........{((((((((.....)))))).)}}......(((((((.((..((..{..(((((((((((.((((((((.((((((((.((.....)).)))))))).(((((.,,({{..((({......})))..))))))))..((((((..........(((...(((((((.{....}.))}}))))....)))...........}))))).)))))))).)))),....}))))))..}..))..)))))))))...)))))))))......))..))))))){((..((((((..((((((.(.(((....((((((......))))))....))).).))))))..)),)}))},(((((.((((.((((...(((.((((((..((((((...((((...)))).....)))}),}}..)))))).)))....}))).))))...)))))..((.{(,,(({..((((((.((((((....)))))).))))))..))).}})))))))).(((.|....})))......)))))..)))))))...))))))).))))))))))((((((((.......(((((((.(.(..((..((.((((((((((((((((((,({({{{((((,(((,,,,,(({,((((,...({{.....{|(((,.{((((..,,....,..)))))....}))),.}|||{.((...,}}..)))..)))},)}..}})))},},},))))))},,).))).))))}.....))))))))(((((((((.((((((((({.(((((({,(((.......((((.((((((.......................)))))).)))))))))))))),,((((((((.(((({{..{({{,{{(((({({{(({||,..,{((,..,|||{{,....,|},,}}}},,{(((((.....,(((((.....))))).,.....)))))).,......{(((((((((....((((((....))))))...)))))))))|((((.(((((..((((((.(,...,).))))))))))),)))).}||||||,...}))))))|,.||||||||,....,,|((((((((((((...((((((({...}))}})))))))))))))))),...((((({{{.((((((((....))))))))..}.}}...))))),},}}.,,)))).}}))..)}.)))}})))).,))))))).........))).)))))))))...(((.....)))(((....))),})))))),.))..).).)))))))..))))))))......))))))))}})}}..)}|{{,},,,|||,,.))}}))}}})),}}}}}})))).})}))),)))}.))})})))))))))))))))).})){{..(((.((((((((((......)))))......(((,.({.((.,....)).)).).)))..)))))..))).|||,,{((({{{{(((((......)))},.......,))))))))))))))).)).))))..))).....)))...)))).....)))))))).))}})}...,)))).)))))))......,{{{,,({...,,..)))}.))))))).)))).)))).}.}))))}},}))))}.))},.......,,}))).))).)))))((((((.(((.(((((,,..((((......))))...,))))).))))))))))))))..)))))))))..)))))))))))||.((,,(((((((((((((((((..{{{.,.,{{{(((,(,,,...{((,,((((((((....((((((.(((((........))))).))))))..,.,....,,,}}}}}}}|.,,,.}},}}}||}}}}}..)))).)))})))))))}).,,||},,.,|||(((|,{(((.,,,{{(({{..,((((({.......,,,)||||||}},,,.||..}})).}}}}}}),,))))}}}.,|{||||{{((((,{....|||||((({{({{(({(((,{{{.....{((((((((((((.,{...,,|||,||||||,.,,.,}|}}}..,}}}}...,,..{{{{{{|,,,,,))),.....})),},}}},...,)))))))))),,..}}}.}}||||.....|||||{{{{{....,||}||||||||||||,,||||||||(((((({....}}))}}},.((((.............)))).,||.|||,}}}))))}}))||||...,||,,((((((....)).))))))})}}..{((({{.|}|}....,{||((((((........)))))}.||||||||||}||,}}}|||((({{,,..,,|||}|||}}|||}}|((((.(.((((((.(((((((((((((((((...,((({{..{((((((({((({....}}}}}.((((.((((((....(((..,.((((((((((,,....((((((....)).))))(((({,((.(((((((((((({......(((((((((((((..(((.((.(((((((.((((.(((,((.((((((((({..,...,,.).))))))))).)}.,.,||,.(((...(((((......))))).))){{.((((((((.(((((((,..,(.((((((((((.(.......,,)))))}}}))).},(((((((......(((((((.(.(((.(........),))).).))))...))).......)))))))(((.((..((((((((((,.(((((......))))).,...,((((((((((((.{{.((((((............))))))..{((((,,,....,,||({....}))}.........|||}}.(((((((.((((......)))))))))))......,,,.((((...))))(((((.......))))).,},)))))))))))).,.....)))...)))))))}).))).))}.)))).))))))))...))}}}.))))))))))).))))))))))...)))))))){{.(((((.....)))))}}...{{{,...,}))....{{{{{....{{{{{..{((((.((.(((((.(((((....)))))..,,...{{{{.......}||,....}|..}}}}}.}}..,))))),,))))),....)))))))))))))))))).))))))),(((((((,,,...(((.......|,,.,{{{...|||..{{...(((((((((((.......,,,.,,,(((((,,({.{((({{,....})))))},)),,||||}..,..,}||||(((((..{{(((,...{({{{((,,|{{{{((,(({,{,{{{{....,,|}}}.|,||||},..,{{{,|{{{.(((((((...))))))).,{{||{..{||{|{}|}|.....}}}})})}}}.}}}))}.....)))}..}}))}}}|{{{{{...,{{,{((((((((,..})}}}}}}||{||||,...}}|}}..,|||,||......)}.,})},,,{(((({....{{{{....}})},}))})).......,,{((((({....})))))}|....(((((((((((((...{{{{...((((((.......))))))..})}}....))))))).))))))..{((.,,,.,,..,..((((..(((...........))).)))).,,.,}}}}}}}}})}})))))..)})}}..,|,,}},,}}}},.)))))))))))..))...})))))))}.,,,.......,},.........,,.)))))))))).}...))).(((((((.(((((..........))))).)))))))..........)))))))))))))))))}((((((((((.(((((((,..{(((((....)))))|(((((......)))))}{((((((((((((((({(((((((((((((.(((((((((..(((((......(((((((..(((((.(((....))).)))))((((((...(((((..((,,{{,,,(((({.((((((((((({.,,,,..(((((,{{(({(((.,.,{{..,,,{,...,||{{(((((((....,((..{{{{,,,,))))..))...})))))))}|||,{({{{|...,..,,....,,}}}||,}}))}}.},..,.{((((((..(((((..((..((((((.{{{...((((((((.....{(((((((((....}))))))))}.,((((((((((.,,.....,,..))))).)))))|((((({(,.....))))))),(((((.(((((.........))))).)))))(((({{{{{{........))))))))))|||,.{{{{|,,|{{((.....))))},,}}}}),....))))))))..}}}.))))))..)).))))){((((((((.....(((.((((({..,{{{,.,,.,,||||...,,....,,,}))).))).....))))))))}...((((.....))))....))))))).},.,}}))))))},.}))}),,....}),))))))}.)))}}}}}.....{{(((((((.......))))))).})|{{{|{......}}}}}},,..,,}}})||{{((,,,,.,.}}}}}}...,.))..))))).....)))))))))))))..(((((((((.{((((.,,.,.{{{{||.((((((((((((.(((((((((((.((.,.{((.......,,)))}.)))))))))))))..))))...}))))))),}}}|))|}}{.(((((((...))))))).}{|||.......))}}..(((........)))...{(((((.....)))))).{((((.(((((..(((..,{,((,,(((((((.((((((({..{{{,.{|.,||||,(((((,((((((((....(((((...(((..,{,....),.))))))))..)))))))).))))),,.,,(((({,.(((((.....)))))((((.(.((((((((.,.({((((.......)))).})}.....)))))))).))))),}}}|}}{{((((((((.((((..(((.....))).)))).)))))))}.|,..(({(({{{{{.......})}}..})))))..{||....,)))}|,||,})},,}))))))).))))))},||,|...{{{,|||{{|,,,,,)}),,))))))))))))))).))))))))))).))).....(((((((,........,.)))))))...)))))..)))))))))((((((....((((((({({{,..........,(((((({............((((((((,.,.....}})))))),,.{{{{|||.,,((({{(((((...))))))))}}))))))))))))).,.{(((((((((((((...((((...(((...(((((((((((((..(((((.(((((..{{{{.(((((((....,{|},...,||{....{|,{{{{...{{{|,..|,,|,,}}})})}},}},))))..}))))))).)))))....(((((((((((.((((((.......)))))).)))))..))))))....))))))))))))))))...))))..))).))))))..))))),),,.,(((((,...,))))))))))))).......))))))...........(((((.(((((((,............................,,)},,.})))))).,..((((....)))).((((..((((((..,......(((((((((..{........),,)))))))))..,.,..))))))..))))))))}.)))))))))))))})))..)))))))))))))))))))}...........{{{{.....)))).))).)))))))|(((((.....{(((({..,,,|||}},|,(({((((,{{,,..||}}}.}}},..,},,}.},..}}},}},||||.,.,,.((((((.((((...(((((((((((((.....((((((((.{{,,...((((((((.(((((((.......,(((.......,}}|((((((..{((((,(((...,.{(((.{{......{.((((((........)))))).}.....)}.)))).).))).}))..})..)))))).((((,,..}}}|.,.(({(....)))).|||,},,,}}},.||||}}.)))}.)))))))...)))..)))))..,..))..))))))))....))))))))))))).....))))))))))..|,,,,...{{{{.|,.....,.))}}.((((.((((..(........)..)))).))))....,...))}}.))))},......((.((((....)))).))))))).)))))))...))).)))))))...)))))).).))))),}}}),.)))))))),}).}}))))))}))}}||{...})},})),}|,|{{((((((((((((((((..{{..(((..,..({(((.(((.(((((........)))))..))).))},)))))..}}..)))))))).((((...(((((......)))))...)))).))))))).)))}{(((((((((((......)))))))))))}.....))))).}))),)))))}..)).........))))))..)))))}..))))))))))..)))),}..}))}....})))))))).})))(((.((.(((.(((.{.((.{,....,),))..}.))).))).)))))(((((((((((((((..,{{(.,,((((.({(,,,,|||,|}}}.))))}}|||}||||,}...{|||,..,))||....)))}}....)))))))))))))))......{{{{{({(({,(((......,.))}.))),,))))))}))))))))......((((((..(((.,{.((((.((.....(((...{{||{,,,||}}}.))),,)).)))).})))).))))))..)))))))))))))))).).)))))))}||,(,,,.||||,........(((.((((((............)))..)))}}|{|{.((,{{{.....))).))}))))}.......)).))))))),})}}}}))))).)))))).....,.))))),.))))))))))..,)))).))))..........)))))).)))))).)))).))))))...(((....)))})))))))))}.,}}},.....,}.}),,..))))}))}.........},||||,,}||}}}}}}}}.,)))))).,,....,{{{.(((((.(((((.{{{{...(({.((((...((((((.{(((((({....)))))))}..........)))))).}|||,|},{,((({....||,...|||||,}}))))},,...,))))..))))).))))).,)).,,.|||||{{{{{..,{{||,,,...)))),..)))))...))))))))).......))))))))))))).,,,.))))),.)))))((((((.{((..,,,(((((,,,.,,{{{..|{,..((((((((((((((((.......)))))),.......}})))))))))...)),,))}},.,.)}}}}))).))))))..{(((((((...{|||.,,,..}}}}.}}}}))))))).))))))),,))))),))).......)))))){((((((.,{,,,....,|,..)))))}||.....,{,((((((((((((...)))))..))))))).,|{,.,,.........,,,..((((((((((({...}))))))))).)).((((((((..((........))..))))))))..,,,},..,.....,,.}}.

Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001113239.3 AUGCUGAGCUGAGCCCCGCCGGCCCUGGCCGCGCGCUGCCCCCGGCUCC… 15248 nt 0.4984
NM_022740.5 AUGCUGAGCUGAGCCCCGCCGGCCCUGGCCGCGCGCUGCCCCCGGCUCC… 15329 nt 0.4983
Summary

This gene encodes a conserved serine/threonine kinase that is a member of the homeodomain-interacting protein kinase family. The encoded protein interacts with homeodomain transcription factors and many other transcription factors such as p53, and can function as both a corepressor and a coactivator depending on the transcription factor and its subcellular localization. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2011]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image