Basic Information
Symbol
HNRNPH2
RNA Class
mRNA
Alias
heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2
hnRNPH'
FTP3
HNRPH'
heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 (H')
HNRPH2
MRXSB
NRPH2
FTP-3
epididymis secretory sperm binding protein
heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H-prime
hnRNP H'
hnRNP H2
Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2
Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H'
Location (GRCh38)
X:101408114-101414137
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_019597.5
Sequence length
2296 nt
GC Content
0.4242
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-667.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-710.95 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
579.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001032393.3 | ACUCGCUUACGUGAGCAGAAGUAGUUCUGGUCGUCGUCUACCGUCUCGC… | 2284 nt | 0.4243 |
| NM_019597.5 | ACUCGCUUACGUGAGCAGAAGUAGUUCUGGUCGUCGUCUACCGUCUCGC… | 2296 nt | 0.4242 |
Summary
This gene belongs to the subfamily of ubiquitously expressed heterogeneous nuclear ribonucleoproteins (hnRNPs). The hnRNPs are RNA binding proteins and they complex with heterogeneous nuclear RNA (hnRNA). These proteins are associated with pre-mRNAs in the nucleus and appear to influence pre-mRNA processing and other aspects of mRNA metabolism and transport. While all of the hnRNPs are present in the nucleus some seem to shuttle between the nucleus and the cytoplasm. The hnRNP proteins have distinct nucleic acid binding properties. The protein encoded by this gene has three repeats of quasi-RRM domains that binds to RNAs. It is very similar to the family member HNRPH1. This gene is thought to be involved in Fabray disease and X-linked agammaglobulinemia phenotype. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding the same protein. Read-through transcription between this locus and the ribosomal protein L36a gene has been observed. [provided by RefSeq, Jan 2011]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
