Basic Information
Symbol
ALDH1A2
RNA Class
mRNA
Alias
aldehyde dehydrogenase 1 family member A2
RALDH2
retinaldehyde dehydrogenase 2
aldehyde dehydrogenase 1 family, member A2
DIH4
RALDH(II)
RALDH2-T
retinal dehydrogenase 2
RALDH 2
retinaldehyde-specific dehydrogenase type 2
Retinal dehydrogenase 2
RalDH2
Aldehyde dehydrogenase family 1 member A2
Retinaldehyde-specific dehydrogenase type 2
EC 1.2.1.36
EC 1.2.1
Location (GRCh38)
15:57953424-58497866
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_003888.4
Sequence length
3386 nt
GC Content
0.4681
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1054.07 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1118.13 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1100.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((..((((((......((((((((.((((((((((.((....)).)))))))..(((((...(((.((((((((..(((((((((.((((.((.(((((....))..))).))((((((((.(((((..(((..((.((..(((((((((..((((...............................)))))))..(((((.((((((.(((((....)))))((((((((.((..(((............((.(((............))).))..))).))))))))))((((....(((((.....))))))))).)))))).))))).)))))).)).))(((((((((((.....)))).)))))))..((.((((((((((...((((.....(((((......)))))(((.(((((((....))...))))).))).))))...)))))))))).))....)))..)))))))))))))...........(((((((.(((((..(((..(......((((((((((((.(..(((((((((.(((((....))).))))))))..(((((..((....))..))))))))..).)))))))))))).)..))))))))))))))).((.((((.......))))))....(((((((....)))))))......((((((((........(((......)))..((((..(((((....)))))...)))))))))))).)))))))))..))))..))))))))..))))))))......)))))))))))..........((((((.((((((((....((.(((((..((((((((((((.(((((((((((((((..(((((((((.(((((((((........((((.....))))((((...((((((((((((.........)))))))))...((((((((.((......((.((((((.((((....)))).)))))).)).)).)))))))).((((...)))).....((((((....(((.((((((.......(((((((.((((.(((((((.(.((((((((((...((((((.((((((((.(((.....))).)).)))))).)).((((.((.(((((....................))))).)).)))).........((((((((.(((((((.((..((((...((((((((((((((((((((......((((((......)))))).(((.(((((((((.(((((((....(((.((((((((((((((.....))))))))(((....)))...((((((((...(((((..((((.((..(((((....(((..(((((((((..((((((((((.((((...((((.........)))).....(((((((..(((((.((..((((...)).))..)).)))))..))...............)))))....((((((((((((.....(((.((((.(((((((.....(((((((((...(((((....(((...(((((((..((.((.((((.....((.(((......).)).))......)))).)).))..((((..(((((((((....(((..(((((((.((.((((..((....((((....((((((.((.((((................))))...)).))))))..))))...))...)))))).)))))))..))).(((...(((.........))).)))(((((....)))))...((((.((((...))))))))((((.(((...((((...)))).........))).)))).(((((((((.(((.............))).)))))))))((((.((((((.(((...(((..((..............((((((...)))))).(((((((....)))))))))..))))))))))))))))....)))))))))..)))))))).)))....)))...))))))))))))))...)))))))...))))))).....))))).....))))))).(((((....)))))..((((....)))).....(((((((((((((...................)))))))))))))....)))))))))...((((((((((.((.(((((..((.....(((((....))))).))..))))).)).))).((.((((((((..(((((.((((.............)))).))))).)))))))).)).....(((((((((..(((..(((((...(((((((((.(((((......))))).)))))).))))))))..)))..)))).)))))))))))).......)))))..))))))))).))).......)))))..))...))))..))))))))))))).............)))))).))).(((((((((.((((..(((.((..(((...)))..)).))))))).)))).....))))).................(((....)))(((((((((((........))))))....)))))((((((...(.((((((((((((........))))))).((((((........)))))).))))).)))))))))))))).)))))))))))).....))))))((....))...))).))))))....)))))....))))...)).)))((((....)))).)))).)))))))).(((.(((((((......)))))))..)))))))...((((((.....)).)))).)))))).)))))))))))).....)))).)))))))..(((.....))).)))))).)))....))))))((((((....))))))..)))...))))....)))))))))........((((............))))........((((((((((......................((((..(((.......)))..))))(((............))).))))))))))........)))))))))....)))..)))))))))...........((((.......)))).....((((....))))((((((..........))))))((.....)).))))))))....)).)))))...))))).))...)))..)))))...))))))(((((((......)))))))((((((....))))))....((((......))))....((((........))))....(((((...(((((......)))))...)))))..............))))))..))......((((.......)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....((,.((({((,..,,.((((((((.((((((((((.((,...)),)))))))..(((((...(((.((((((((..(((((((((.((((.,(((((({....{({({,,....,)))).|{(((({,.{{((((({(({{,((({((,..(((({...,..,{..,.......,|||.........,,,(({{{.{,,,,.{{({({.((((,....}))))|,|||....,,..}}})).,)})}.,.})}}}}|,...,,,.....)),}))..)))}),,,,,}},...||,}}|(((((,,,,,||||||{{{{({||||,|,,,|.},},))}}}}}},{{{{{{||||.{{{{||||{|{||||{.{({.{(((((((((...(((({{{{{,{,,.....,.))))|(((.((((({{....})...))))).))).))))...)))))))))}.,,....}},,,})))))}}}}},,.....}}}}}}|||,,,|,|||||}.|||}}|......((((((((((((.(..(((((((((.(({({....})).))))))))..{{({,..((,...)}.}}))})))}..}.))))))))))))....,,,}}}||||}|||||{{(((({....,,,|}}}||,,{,{{({{(({{,,|||,,,,}}}}},..}))}}}}}.)))}}||,...,,.})},.|||},,|}}})|||||{{.....})))))))))))))))))))))..))))..))))))))..))))))))......))))))))))).....||,..((((((.((((((((.,..{(.(((((..(((((({{((((.(((((((((((({{(..(((((((((.(((((((((..,,..({(((({{...||}|(({{..,{{|{(({{((({.........)))))))),..,(((((({{,{{.,..,.{(.((((((.((((....)))).)))))).)).}).,))))}}}{((((,,.}}}},,{{{((((((....(((.((((((.......(((((((.((((,(((((((.{.((((((((((..,{(({((.((((((((.(((.....))).)).)))))).)).((((.((.(((((..............,.....))))).)).))))...,,|}||((((({{{.{{{{||(|,,..{(((,,,((((((((((((((((((((,.....((((((......)))))).(((.(((((((((.(((((((..{{{{{((((,..((((((((.....)))))))){{{,,,,|||...{((((({{,..{{{{({{((({,{{,{((((||...(({,,(({{{{{{{..{,||||{|||,((((,{.((((.........)))).....,,{{.((..(((((.((..((((...)),})..)).)))))..)).,,,,{||||.{...{{{{,,..{((((((((((((....))||.{{{{.(((((((.....(((((((((...(((((....{((...(((((((..((.((.((((.....((.({{......}.}}.}}......)))).)).}}..((((..(((((((((.{,.((,..(((({({.{{.{{((,,{{{{,{((((,,,,({((((({,.((({...,.........,,,)}))...|||||||}|..,,||{.{|..{{||,|||.||||}}|{,|||.(((...(((.........))).))).||||}.}})))))}}}|{{|,,|||.,,))))))),{{||,{{....{{,....,}))}},,,|}}|},,.,}|}|{((((((((,({{.{.,,...,.||{,|}.,||||}}}|||||.{{{||{,((,..,(((..{{,,........},..{(((((...)))))}.(((((((....)))))))))..)))))))))))))))),,,.)))))))))..)))))))).)))...,)))...))))))))))))))...))))))),,.}}}}}||..,,|}}}})|...,||})))).,|||||}|||,,||,,((((....}||}..,..(((((((((((((.....,,......,,....)))))))))))))..,.)))}}}}}|,,,((((((({(,.{{.(((((..({{,({{(({{{...,)))}).,}..)))}).}}.})),|{.((((((((..(((((.((({.............}))).))))).)))))))).}}...,,((((({{{{,,{{{..{{{{{,,.{{|{|||||,|{(((,,,.,{||||}.}}||||,|,|}|||}.,|||,,|}}|,|||}}}}}}}}}.......}},}}..|||||||||{{|.....,..,,||{{{,|,,.,,,}..)}}}})))))},........,}}}}))))))}.{{..(((((((((.((((..(((.((..(((...)))..)).))))))).)))}....,))))).,}..,{{,,....,,}}},,,,,,.}||{||..||}}||,},,,...,.},.},.}))))||||,}}))))|}}||||{{{||,,,,,,..)})}}}}.((((((........)))))).))))}..})))},))))))).)))))))))))),,...)}}}}|((,...))}..})).))))))...,))))).,.,))}),.,,},,,}||||,,.,)))).)))),)}))}}}}{{{{.(((((((......)))))))..})))}}}...(((({{.....)),}})).))))))}})))))))))))...},)))).)))))))..,{{.....,}),)))))).)))....))))))||||||....)))))).,}}},})))),},..)))))))))....,..,|{{{............)))}........((((((((((.....,........,,.,,...((((..{{{...,,},)))..}}}|(((............))).))))))))))........))))))))}....)}}..)))))))},,,,|.|{|,.,|{||.......)),)},.}}||||....,},|(((({{.,.,,,....}}}}))|,...,,))}))))))))....},})))))...))))).}}.,,))),.}))))...)))))){((((((......)))))))((((((....}}}}}},,}}|||{,|....}})),,,,|||})},,}},.,,......(((((...(((((......)))))...}))))......||,....,)))))),.}}.....,||{{......,))}}.
Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001206897.2 | GGACCGCGCGCACAGCCCGCACUGCCCCACGCCGCGGGCUAGGGACACC… | 3483 nt | 0.4660 |
| NM_003888.4 | GGACCGCGCGCACAGCCCGCACUGCCCCACGCCGCGGGCUAGGGACACC… | 3386 nt | 0.4681 |
| NM_170696.3 | GGACCGCGCGCACAGCCCGCACUGCCCCACGCCGCGGGCUAGGGACACC… | 3272 nt | 0.4664 |
| NM_170697.3 | AGUUGUGCCUCUUCCUCUCUAACAGGCAGAUAUAGACAAAGCAGUGCAG… | 3128 nt | 0.4562 |
Summary
This protein belongs to the aldehyde dehydrogenase family of proteins. The product of this gene is an enzyme that catalyzes the synthesis of retinoic acid (RA) from retinaldehyde. Retinoic acid, the active derivative of vitamin A (retinol), is a hormonal signaling molecule that functions in developing and adult tissues. The studies of a similar mouse gene suggest that this enzyme and the cytochrome CYP26A1, concurrently establish local embryonic retinoic acid levels which facilitate posterior organ development and prevent spina bifida. Four transcript variants encoding distinct isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, May 2011]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
