Basic Information

Symbol
HPRT1
RNA Class
mRNA
Alias
hypoxanthine phosphoribosyltransferase 1 HGPRT Lesch-Nyhan syndrome hypoxanthine guanine phosphoribosyl transferase HPRT hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase HGPRTase hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase 1 testicular tissue protein Li 89 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase EC 2.4.2.8
Location (GRCh38)
X:134460155-134520513 UCSC Genome Browser

Secondary Structure

MANE Select
NM_000194.3
Sequence length
1395 nt
GC Content
0.4043

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-363.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -393.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 386.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...(((((((((((.((((((...(((....)))...))))....))))))..)))))))...)))((((((((..((((((.((..(((...((((...((((...((((.((((...((((.((......)).)))).(((((.(((........))).)))))..((((((((..(((((((((.((((....)))).).)))))....)))..))))))))..)))).))))...))))..)))).(((.(((....))).))).....((((((((.....)))))).)))))....)).).)))))...)))))).......((((((((((((.((....)).)))))))))))).....((((((((.((((.(((...)))..))))((((.((((((((((.((((........)))).)))))...)))))))))(((((((.(((((((.(((((((((...((((((((((((........(((((((((((.(((((((((((.((((((((((((.((((..(((((.........................)))))..)))).)).))))))((.(((((((.((((.........((((((((((..(((((((((((((......(((.((.(((((((.((((.......))))))))))).)).)))......)))).))))))))).(((.....))))))))))))).((((....(((((....))))))))).(((((....(((((...)))))....)))))))))...))))..))).)))))).))))))))...)))..)))))((.(((.....))).))........(((((.((((((((((.(((((((((..(((((...))))))))((((((((((((......(((......))).........(((((.((((.(((...))))))).)))))...((((((((((...(((((...........((((((((....)).))))))..)))))...))))))))))....(((((((........(((....(((((..........)))))....)))........)))))))((.(((((((((....))))))))).)).......))))))))))))....)))))).))...)))))))).)))))...)))))))))))).........(((.((.(((...............))).)).)))...........)))))).))))..))))).))))))).)))))))...(((.((((((......................)).)))).)))....)))))))).............)).......((((((......)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((...(((((((((((.{(((((...(((....)))...)))),...}})))},.)))))))...))|({((((((..((((({.{(,{{((,{,({{{,,,{(((...((((.((((...{(((.((,.....)).)))}.((({{.(((........))).)))))..((((((((,{({((((((.{((((....)))},).))))),...)))..))))))))..)))).))))...)))}.,}}}}.{{{.(((....))).}},...,|{|((((((....,)))))}.}})))},}}}}.).}))))..,)))))),,.....((((((((((((.((....)).)))))))))))).....{(((((((.{(((.(({...}})..)))}((({,((((((((((.((((........)))).)))))...)))))))))(((((({.(((((((.(((((((((...((((({,({{..,,,.,...,{{{{((((...,})))}||||{{..,({{{.,,..((((((((,{((((({.....,{((((({(((((....,,.|{{,(({(({((({{({{{{{{{{{{,.,,,,..,||,..,{({{{{{{{|,|(((((((((((((......(((.((.(((((((.((((.......)))}))))))).)).)))......)))).))))))))).{,,,....,},}))))))))).,{{|||,,|||||||,||||,}},.|,{{{||.||,|{{{{...}}})),.,,)))},,,.}.,.,||}.{{{{{,,.,|{{|{|,.,,.|}}}|}..}})))))}})).,,}||||,|||}}}||,.(((((.((((((((((.((((((,{{..(((((...)))))))|((((((((((({....,,((({{,....,,,,.....,.(((((.((((.(((...))))))).))))}...((((((((((...{{{{{...||{{{.,.((((((((....)).)))))),,))))}...)))))))))}....{((((((.....,{{(,{.,,.(((((..........))))).,.})))........))))))}{{.(((((((((....))))))))).}}.,}}}}})))))))))))),...)))))).))...)))))))).))))).|||....}}))}}|}.....,|,....}}.))))))))))))))),}}))))...)))}.,,)))).}})))))).))))..))))).))))))).}))))))...(((,({{{{,.......,,..,,.........,},,))),))}....)))))))}.............)).......{{{{{,......,}}}}}.

Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_000194.3 AGCUUCAGGCGGCUGCGACGAGCCCUCAGGCGAACCUCUCGGCUUUCCC… 1395 nt 0.4043
Summary

The protein encoded by this gene is a transferase, which catalyzes conversion of hypoxanthine to inosine monophosphate and guanine to guanosine monophosphate via transfer of the 5-phosphoribosyl group from 5-phosphoribosyl 1-pyrophosphate. This enzyme plays a central role in the generation of purine nucleotides through the purine salvage pathway. Mutations in this gene result in Lesch-Nyhan syndrome or gout.[provided by RefSeq, Jun 2009]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image