Basic Information

Symbol
HSPBP1
RNA Class
mRNA
Alias
HSPA (Hsp70) binding protein 1 FES1 hsp70 interacting protein HSPA (heat shock 70kDa) binding protein, cytoplasmic cochaperone 1 hsp70-binding protein 1 heat shock protein-binding protein 1 HSPBP Hsp70-binding protein 1 HspBP1 Heat shock protein-binding protein 1 Hsp70-binding protein 2 HspBP2 Hsp70-interacting protein 1 Hsp70-interacting protein 2
Location (GRCh38)
19:55262219-55280930 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001130106.2
BLAST PRIMER
NM_001297600.2
BLAST PRIMER
NM_012267.5
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_012267.5
Sequence length
1635 nt
GC Content
0.6385

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-766 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -789.1 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 411.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((...)))((((((((((..((....))))))))).)))..((((((((((((.(((((((....(((....)))((.......)).)).))))).))))...))))))))....((..((((((((((((.((........(((.(((((.((....(((.....)))..)).)))))...)))(((((((((((.(((......((((((((((((..((...))..))).....))))))))))))))))))))))).(((((((((.((((.....))))))))))).))..((((.(((((..((((.(.((((((.((.(.((((.(.((((...(((....(((((((..........))).))))...))).)))).).)))).))))))))).))))).)))))..))))..)).)))))))))))).)).((((((((((.((((((((((.((.....(((((.((((((((..((((((...(((((......)))))..))))))((((((((..((((((..((((((((((((((.(((((.......(((.(.((.(.((((((.((((((((..(.(((((((...((((....)))).))))).))..)..)))))))))))))).).))).)))))))))))).))))(((((((..(((((.(((...((.((....((.....))..)).))(((((((...((((((((.(((..(((((((((((.(((((((.(((.((((........)))))))))).((((((..((((((...((((((((......))).)))))))).(((((((.((((...((((...((((.((((.((((((.(..((.((((((.....(((((((((((.((.(((...)))....)).)))..))))))))...(((.((((.(((((((((((........)))).(((((((...))))))).))))))).)))).))))))))).))..).))))))...))))...)))).((((....))))))))..)))))))))))(((..(.(((.(((((((.....)))).))).))).)..))).)))..))))))(((((....)))))((....))...)))).))))))))))))))))).))))).((((((((.((...((((((.........)))))))).)))))))).)))))))....))).)))))..))))))).....((((.((((((((((((((......(((...)))((((.....))))...(((.(((((...(((((((((((....)))..).))))))))))))...))).((((((..((((((.......))).)))..)))))))))))).)).))).))).))))))))))..)).))))..)))....)))))..........(((((((((((((.......((.(((((((((((((((..............................))))))))).........))))))))))).)))))))))).)).)))))).)))))...)).)))))))).))((((..............))))..)))))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({((({((((.(((((((..(((((((((((({....}))))))}((((((((((((.(((((((....(((....})),,.......,..)).))))).))))...))))))||,.{,({,.((((((((((((.((........(((.(((((.((.,..,,,.....}))..)).)))))...)))(((((((((((.(((.....,((((((((((((..({...))..))}.....))))))))))))))))))))))).(((((((((.((((.....))))))))))).))..((((.(((((..((((.(.((((((.((.(.((((.(.((((...(((...,(((((((,.........))).)))).}.))).)))).).)))).))))))))).))))).)))))..))))..)).)))))))))))).||,{.||},|,|)))}}})}|.{.{(({...)})),|..(((((((.(((((((...(((((......)))))..)))))).,.,.,.}.)))))))))))..))))))).)).)).{.((((((.(((((......((((((.((((((((..(.(((((((...((((....)))).))))).))..)..))))))))))))))((((((((((.((({{{{{...))},.,}).))).})))))).,...((((..,{({,{{((((((.((((((,...((,((((((((,,,,..(((((((((((.((({(({,(((.((((.,......)))))))))).((((((..{{{|{{.{(((((((((......))),))))))),}||(((((.((((,.,((((,,.((((.((((.((((((.(..((.((((((.,,{,(((({{(((((.((.{{,...,},....)).))),,}))))))),..(((.((((.(((((((((((........)))).(((((((...))))))).))))))).)))).))))))))).))..).))))))...))))...)))},((((....))}})))),,||||}}}}}||({{..|,|{{.,{{||||,,,..)))).))).))),)..)))})}}..))))))(((((....)))))||....)).}})))).)))))))))))..|,((((...(((((((..((((.({((((((.........)))))(((((((((.((.,.(((((........)).)))...)).))))}}))))(((.....)))(((........))),}}.)))).))))))).)))},{((.(((((,..{((((((((((....)))..).))))))))))))...))}.((((((..((((((.......))).)))..))))))..)))))))},))...)))))).))))))))),..)))).,,))))).)))))).,...{(((((.(((((((,((..,{{,{{{{,......,}}|||}..,,,,{{(((({,{(({(((((({.(({{{((({{,.,,.......,))))))))))})))))).))))))))))),,.)))..}))))))..))))))}}}}||.{((((.{((({....))))).))))).,}}}}}.

Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001130106.2 GCAAAAGUAUCGGGGGCGGGACUCGCUGAGGUGCGAAAACUGGGCCAGG… 1799 nt 0.6442
NM_001297600.2 GUUGCUAGGGAGAAAGGAGAGGCUUAUGACUUUGGGGAAGGGUCCUGUG… 1713 nt 0.6328
NM_012267.5 AGAUGGCGGCGCCCAGCAGAGUCAGGUGCGGACGACUUUGUCUGUAGGA… 1635 nt 0.6385
Summary

Enables molecular sequestering activity and ubiquitin protein ligase binding activity. Involved in positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process and positive regulation of protein ubiquitination. Is active in extracellular space. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image