Basic Information
Symbol
IARS
RNA Class
mRNA
Alias
isoleucyl-tRNA synthetase 1
ILRS
isoleucine tRNA ligase 1, cytoplasmic
isoleucyl-tRNA synthetase
GRIDHH
IARS
ILERS
IRS
PRO0785
isoleucine--tRNA ligase, cytoplasmic
Isoleucine--tRNA ligase, cytoplasmic
Isoleucyl-tRNA synthetase
IleRS
EC 6.1.1.5
EC 6.1.1
Location (GRCh38)
9:92210207-92293854
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_002161.6
Sequence length
4483 nt
GC Content
0.4334
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1292.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1376.16 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1058.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((.......)).)).)))((((((.(((.((((((((((((((.(((((((((((.(((((((((...((((.((.((((((......)))).......(((((.(((((((((((((((((.(((....((((.....))))..)))...)))..)))))))..))))))).)))))(((...)))................................)).)).))))....)))..)))))).)))))..((((....))))...)))))).(((((((((((((((((.((......((((((((((.(((.(((((((.........(((((((((..((((.((((((((..(((.(((....(((....................))).....))).)))....)))))...))).))))(((((((.......(((.(((.((((((((............((((((((((((....)))))..)))))))...........))))).))).).)).))).......)))))))))))).)))))))))))))).))))))))))((((......((((((((..((....))..))))))))(((.((..((((((((.........))))))..))..))))).((((((....((((.(((....(((..(((((((.......)))))).)..)))))).)))).....)))))))))).)).)))))))))))))))))..(((....)))....(((((..((((.(((((....))))).))).)....)))))....(((((((.(.........).)))))))..(((........))).......(((((.(((((((((((.(.(((((.....))))).)))))((((.(((...(((..(((((((((((((((.......))))).(((((((((((....)))))..))))))((((.((((.....((((.((((((((((((((.((.((.(((....))).)).))....(((((.(((((....(((((((.((.(((((((......).))))))))....(((((((((((...............(((.........)))((((((..((((..((((((((((..(.(((((((((....((((......))))......)).))))))).)..))))....))))))..)))).(((((......)))))((..(((((((..(((.....((((((((..(((..........)))((((........)))).......((((((.((((.....)))).)))))).))))))))..((((((((((((((((....((......(((((........))))))).))))))))..........(((((....)))))((........))..((..(((((.....)))))..))......(((((...)))))..))))))))(((((....)))))...(((((((((((.((((((((((((((((((.((((......((((..(((.....((((...)))))))))))...)))).))).))).))))))..........((((((((((((((((...((((((.((.((((..(((...(((((..((((((..((.((((...)))))).(((((((((.((((((((.((((....)))).))(((((((((((......)))).)))))))..(((((((((((...(.(((.((((((((.((......)).))).)))))..))).)...))))))...((((((..((((((((.((......)).)))).)))))))))).))))))))))))))......))))))..................))))))))))).....))).)))).)).)))))).))).))))(((((...)))))....((.(((((......(((((.((.....)).))))).....)).))).))((((.((((((....)))))).))))))))))))).)))))).)))))))))))....((((....)))).))).)))))))..))...))))))...(((((......)))))...((((......)))))))....)))))))))))))))))))))))))...(((((((..............)))))))....((((.(..((((........))))).))))..((((((((((.(((((...(((((((((..........)))))))))....)))))........(((((...(((((.((((..(((((((((((((((((((.......)))))((((((((((.(((.((((...((((.((((((((.(((((((((.....(((...........))).....))))))).))(((((((((((((((..((((..(((((((((...((((((..........))))))....))))))........))).))))..)).)))))).).)).))))...((((((((.((((.(((((..((((....))))))))).))))..........(((((.........((((((...((..((((((....))).)))..))......((((.((((((.....))))))))))........(((((((...))))))).(((((..((((.(((.................))).)))).))))).))))))(((.((((.......)))).))))))))))))))))))))))))..))))((..(((((.....))))).))......)))).))))))).))))))(((((((....)))))))(((....)))...)))))))....))))))).......)))).)))))...))))))))))))))))))).))))))..)))).)))).....))))))))..((.((..((((.(((..((..(((((((....))))..)))...))..))).))))..)))))))))))))).)))))).))))..........(((.....)))))))))))))))((((.((....)))))).........))).)))))))))))))).))))))....((.(((.((((((((((.(((((((..(((........)))..)))))....(((((........)))))((((((((((...((((.................(((..((((((((((...((((............)))).)))...)))))))))).(((((((((((((.((((........)))).))))))...))))).)).......(((((...))))).((((((((((...((((.((..((((...))))......(((((((((((....))))((((((((((..((.....((.((((((((.((((.(((......)))))))..............((((((.....((((.((((.......((((...))))(((((...((((((........))))))..))))))))).))))......))))))...........))))).))).)).....))..))))))))))....(((((..(((((...(((.((((((((........))))))))...)))....)))))....((((((((((........((...((((((((..((((...((((((((....)))..)))))..))))..)))))))).))....)))))))))).)))))(((((((((((......))))((((((...(((((...(((((........((.((((..((((((..........))))))...)))).))......(((((((..(((((........((..((.(((((((...((((((((.......((((((.......))))))))))))))....)))).))).))...))........)))))..)))))))....)))))..)))))..))))))..)))))))...((((((..(.(.((((.(((....))))))).))))))))........))))))).....(((((((((.((.(..(((.(((((((((.(((((.((((((((((.((.(((......))).)).)))).))))))..)))))......))))))))).)))..))))))))))))..............)).)))))))))))))).)))).))))))))))(((((((((((((((....(((((((.........(((.((........)).)))............))))......)))...)))))))))))))))........(((((..........)))))))))))))).))).))).))..((((..(((..............))).))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((.,.....)).)).)))((((((.(((.((((((((((((((.(((((((((((,((((({{{{.{.((((,{{.{((({{......||||,......(((((.(((((((((((((((((.(((...,((({.....))))..)))...)))..)))))))..))))))).))))),,|..}))))...................,,,........})}.)),}}}},...))}..)))))}.)))))..,,||,,,,,}},,.,)))))).(((((((((((((((((.({.,,...((((((((((.({{{(((((((.,,.({{,.,.||||.((((,,,,.||||((((,,(((.(((....{{{..,,.........,|,,...))),....))).))).,..)))),...||,{{{||(((((((....,,,(({.{(({((({{{{{.....,.,....((((((((((((....))))}.,)))))))}))},},.,,.))))).)}},).}}.}}}.......))))))))))).)},..)))))))))).)))))))))),{||...,..((((((((..(,....)),.)))))))){{{|{{..{{((((((.........))))))..,}.,,},,}{{(((({....((((.{{{...{{{{..,((((((.......)))))).,,.}))))).)))).....})))))),,,.}).)))))))))))))))))..{((....}}}....(((((..,(((,(((((....))))).)}),)....)))))....(((((((.(.........).)))))))..(((........))).......((({{{(((((((((({,(.(((((.....))))).)))}}((((.(({..,(((..((((((((((,((({.,,,,..,}|||.{{((.(((((((((((({{..((.((((((,,{((({.....,{,,{((((,,,,,{,|||}|{.||.,|,,.,,}}}.,)))))).}}..}}.))))))),.{((((((.((,{(({{{{...,,.),)}|}}}}|.,,.(((((((((((..,...........,{{{..,......}}}((({{{,,((((,,(({(((({{{..{,(((({{{{{|,.,{|||.,,..,}))),...,.}}.))))))),|,{||},....))))))..}}}}.(((((......)))))((..(((((((..(((.,,,,({{{{(((.((((..........)))||||........||||.{{....((((((.((((.....)))).)))))).}))}))))..{{{|||||((((((((....((......((((({......,))))))).))))))))..........|,.(((((((((((,(,.......,,..,,..,|||.}}}}})))))}.,,.,....(((((...)))))..}}}))))}(((((....))))),..(((((((((((.((((((((((((((((((.((((......((((..((({....{{{{...}}}))))))))...)))).))).)))}})))))..........(((((((((,((((((...((((((.((.((((..(((...(((((..((((((.{({.((({...})))}}.(((((((({{((((((((.((((....)))).))(((((((((((......)))).))))))),.(((((((((((...{.(((.((((((((.,(,,....,),))).)))))..))).,...))))))...((((((..((((((((.{{......}).)))).)))))))))).))))))))))))))......))))))...,,...........}}))))))))))).....)}).)))).)).)))))).))).)))|(((((...)))))}...((.{((((.,....(((((.((.....)).))))).....),}))).))((((.{(((((....)))))}.))))))))))))).)))))).)))))))))))....{{{{....)))).))).))))))),.))....,,,,}..,(((((,,,..,|}}},,,.,|||}}}},,},,}}}}....))))))))))))))))))}}|}}||,|||{(((({,{,,{((({{{{..{{(|(({,...{((|,{||{{{{........}}|||||}}|,,((((((((,..(((((.,.(((((((((,....,,...)))))))))..}.))))}.(((({(((((((...(((((.((((..((((((((((((((((({(.......}}}}}((((((((((((((.((((.,,(({{.((((((((.{{(((((((.....(((.......,...))).....})))))),||((({{({(((((((({,((((..{,,((((((...((((((..........))))))....))))))........))).}}))}.))))))))).).)).))))...((((((((.((((.(((((..((((....))))))))).))))..........(((((.....,...,{{{{{...((..((((((....))).}))..)).....,((({{((((((.....))))))))))..,,....(((((((...))))))).|{{{{..((({.{((((,,..........,,.,)).}))).})))}}},,}}}(((.((((.......)))).)))))))}))))))))))))))))..}}}}((..(((((.....))))).)),,,}..)))).))))))).)))))){((((((....))))))|(({....}))}..))))))),...})))))).....,.)))).)))))...))))))))))),))))),,))})))}|||}{{,,{((({.,....,)))))))).|||,,|||}|||.}|..,}},{{{{..,,))}|,|}}},,))).,})),})))).,))))))))))))).)))))).)))).....,,,|.{{,...,,)))))))))))))))((((.((....)))))).........)))}}))))))))))))).))))))...,((,({{,{{,.{{{{{{.,.,,{({.{{,...((((((({.((((...))))(((((........)))))((((((((((...((((.................{{{..((((((((((...((((............)))).)))...)))))))||},(((((((((((((.((((........)))).))))))...))))).)}.}..,..(((((...))))).((((((((((,,(((((.({..,{{|,..)))),}....((((((((((((({{,|({(((,,,,,||{{{{,....}}}||||||||}((((.(((......))}))))..............{{((((.....((({|..(({{......|||}..}}}}{((((...((((((........))))))..)))))}}}}.)))}......)))))).....{{(({...(((((({,,{{,,..{{..,,{(,(({(((({.(((((..(((((...(((.((((((((........))))))))...)))....)))))....((((((((((........((...((((((((.,(((({{{(((,,,,,.....)))})))))},,)})..)))))))).))....)))))))))).))))){((((({{{{{......||}}((((((.,.(((((.,.(((((..,,,,,,((.({({..{(((((,.........})))))...)))}.))..,...(((((((..(((((........,,..((.(((((((...(((((({{.....,.((((((.......))))))))))))))....)))).))).))..,}}.....,..)))))..)))))))..,,)}}})..))))).,))))))..)))))))........}}}}}}}}}}.,)|,.,},),)))))))))))))}}}}},}}.))))))).,,,.{((((((((,,(,(,,(({.{{|||||||.|||||,||||{|||{,.,,.,(({{,.,,|||,||.||||||}}}}|,.}||||,,....}}))))))).)})..))}))))))}}}.,,..,,}}}},..)),))}})))))))))).)))).))))))))))(((((((((((((((....(((,{{,.........,{(.((.,,.....}),))){,..,,..,,,.}}}}......)))...)))))))))))))))........,((((..........)))))))))))).,.,},..}},},.)))),}}.,,...,,,,,...,,............
Summary
Aminoacyl-tRNA synthetases catalyze the aminoacylation of tRNA by their cognate amino acid. Because of their central role in linking amino acids with nucleotide triplets contained in tRNAS, aminoacyl-tRNA synthetases are thought to be among the first proteins that appeared in evolution. Isoleucine-tRNA synthetase belongs to the class-I aminoacyl-tRNA synthetase family and has been identified as a target of autoantibodies in the autoimmune disease polymyositis/dermatomyositis. Alternatively spliced transcript variants have been found. [provided by RefSeq, Nov 2012]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
