Basic Information
Symbol
IL19
RNA Class
mRNA
Alias
interleukin 19
IL-19
MDA1
ZMDA1
IL-10C
NG.1
melanoma differentiation associated protein-like protein
interleukin-19
Interleukin-19
Melanoma differentiation-associated protein-like protein
Location (GRCh38)
1:206770764-206842981
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_153758.5
Sequence length
1347 nt
GC Content
0.4915
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-443.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-470.01 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
330.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001369605.1 | AGAGAGCACUGAGAGGAGACACAAGGAGCAGCCCGCAAGCACCAAGUGA… | 947 nt | 0.4741 |
| NM_001393490.1 | AGUCUUUCCUCAUUUACAGCUAGCUCUGCCAGUCUGUGUCUUUGCUGUG… | 1099 nt | 0.4786 |
| NM_001393491.1 | AGAGAUGUGGUCUCGCUUUGUUGCCUACACUGGUCUCAAACUCUUGGCC… | 990 nt | 0.4737 |
| NM_013371.5 | AGAGAUGUGGUCUCGCUUUGUUGCCUACACUGGUCUCAAACUCUUGGCC… | 1677 nt | 0.4627 |
| NM_153758.5 | AGUCUUUCCUCAUUUACAGCUAGCUCUGCCAGUCUGUGUCUUUGCUGUG… | 1347 nt | 0.4915 |
Summary
The protein encoded by this gene is a cytokine that belongs to the IL10 cytokine subfamily. This cytokine is found to be preferentially expressed in monocytes. It can bind the IL20 receptor complex and lead to the activation of the signal transducer and activator of transcription 3 (STAT3). A similar cytokine in mouse is reported to up-regulate the expression of IL6 and TNF-alpha and induce apoptosis, which suggests a role of this cytokine in inflammatory responses. Alternatively spliced transcript variants encoding the distinct isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
