Basic Information
Symbol
INPP5B
RNA Class
mRNA
Alias
inositol polyphosphate-5-phosphatase B
type II inositol 1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase
inositol polyphosphate-5-phosphatase, 75kD
inositol polyphosphate-5-phosphatase, 75kDa
5PTase
phosphoinositide 5-phosphatase
OCRL2
Type II inositol 1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase
75 kDa inositol polyphosphate-5-phosphatase
Phosphoinositide 5-phosphatase
EC 3.1.3.36
EC 3.1.3
Location (GRCh38)
1:37860696-37947077
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_005540.3
Sequence length
4450 nt
GC Content
0.4921
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1646.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1725.73 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1197.08
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
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| NM_001350227.2 | GAGGAGCUUGAGGAAGCAGGCAGGGAAAUGUCUGCCGCCGCCGGCUCUC… | 3891 nt | 0.4760 |
| NM_001350228.1 | UAGAGACGGGGUUUCACCGUGUUGGCCAGGAUGGUCUCGAUCUCCUGAC… | 4343 nt | 0.4796 |
| NM_001365820.1 | GAUGCAAUGGGCCUGCUGGGGCGGGGGUGAAGGGCAAGCAGCAAUGGGA… | 4482 nt | 0.4915 |
| NM_001365821.1 | AAAUGUAGUCACUGUCCCGGAACCUGGGGCAGCGGAGUCCCGUGCGCCC… | 4448 nt | 0.4915 |
| NM_001365822.1 | GAUGCAAUGGGCCUGCUGGGGCGGGGGUGAAGGGCAAGCAGCAAUGGGA… | 4384 nt | 0.4902 |
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| NM_001365824.1 | AAAUGUAGUCACUGUCCCGGAACCUGGGGCAGCGGAGUCCCGUGCGCCC… | 4636 nt | 0.4933 |
| NM_001365825.1 | AAAUGUAGUCACUGUCCCGGAACCUGGGGCAGCGGAGUCCCGUGCGCCC… | 4356 nt | 0.4904 |
| NM_005540.3 | GUAGUCACUGUCCCGGAACCUGGGGCAGCGGAGUCCCGUGCGCCCUGUG… | 4450 nt | 0.4921 |
Summary
This gene encodes a member of a family of inositol polyphosphate-5-phosphatases. These enzymes function in the regulation of calcium signaling by inactivating inositol phosphates. The encoded protein is localized to the cytosol and mitochondria, and associates with membranes through an isoprenyl modification near the C-terminus. Alternatively spliced transcript variants of this gene have been described. [provided by RefSeq, Jul 2014]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
