Basic Information

Symbol
INPP5B
RNA Class
mRNA
Alias
inositol polyphosphate-5-phosphatase B type II inositol 1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase inositol polyphosphate-5-phosphatase, 75kD inositol polyphosphate-5-phosphatase, 75kDa 5PTase phosphoinositide 5-phosphatase OCRL2 Type II inositol 1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase 75 kDa inositol polyphosphate-5-phosphatase Phosphoinositide 5-phosphatase EC 3.1.3.36 EC 3.1.3

Secondary Structure

MANE Select
NM_005540.3
Sequence length
4450 nt
GC Content
0.4921

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1646.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1725.73 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1197.08
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
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NM_001350227.2 GAGGAGCUUGAGGAAGCAGGCAGGGAAAUGUCUGCCGCCGCCGGCUCUC… 3891 nt 0.4760
NM_001350228.1 UAGAGACGGGGUUUCACCGUGUUGGCCAGGAUGGUCUCGAUCUCCUGAC… 4343 nt 0.4796
NM_001365820.1 GAUGCAAUGGGCCUGCUGGGGCGGGGGUGAAGGGCAAGCAGCAAUGGGA… 4482 nt 0.4915
NM_001365821.1 AAAUGUAGUCACUGUCCCGGAACCUGGGGCAGCGGAGUCCCGUGCGCCC… 4448 nt 0.4915
NM_001365822.1 GAUGCAAUGGGCCUGCUGGGGCGGGGGUGAAGGGCAAGCAGCAAUGGGA… 4384 nt 0.4902
NM_001365823.1 AAAUGUAGUCACUGUCCCGGAACCUGGGGCAGCGGAGUCCCGUGCGCCC… 4633 nt 0.4934
NM_001365824.1 AAAUGUAGUCACUGUCCCGGAACCUGGGGCAGCGGAGUCCCGUGCGCCC… 4636 nt 0.4933
NM_001365825.1 AAAUGUAGUCACUGUCCCGGAACCUGGGGCAGCGGAGUCCCGUGCGCCC… 4356 nt 0.4904
NM_005540.3 GUAGUCACUGUCCCGGAACCUGGGGCAGCGGAGUCCCGUGCGCCCUGUG… 4450 nt 0.4921
Summary

This gene encodes a member of a family of inositol polyphosphate-5-phosphatases. These enzymes function in the regulation of calcium signaling by inactivating inositol phosphates. The encoded protein is localized to the cytosol and mitochondria, and associates with membranes through an isoprenyl modification near the C-terminus. Alternatively spliced transcript variants of this gene have been described. [provided by RefSeq, Jul 2014]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
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