Basic Information
Symbol
ISPD
RNA Class
mRNA
Alias
CDP-L-ribitol pyrophosphorylase A
hCG_1745121
IspD
Nip
notch1-induced protein
4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase homolog (Arabidopsis)
D-ribitol-5-phosphate cytidylyltransferase
isoprenoid synthase domain containing
LGMDR20
MDDGA7
MDDGC7
hISPD
2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase-like protein
4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase homolog
testicular tissue protein Li 97
ISPD
Isoprenoid synthase domain-containing protein
EC 2.7.7.40
Location (GRCh38)
7:16087525-16502504
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001101426.4
Sequence length
5742 nt
GC Content
0.3859
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1864.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1968.79 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1512.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
This gene encodes a 2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase-like protein. Mutations in this gene are the cause of Walker-Warburg syndrome. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2012]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
