Basic Information

Symbol
JUN
RNA Class
mRNA
Alias
Jun proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit c-Jun AP-1 v-jun avian sarcoma virus 17 oncogene homolog jun oncogene AP1 cJUN p39 transcription factor Jun Jun activation domain binding protein activator protein 1 enhancer-binding protein AP1 proto-oncogene c-Jun proto-oncogene cJun transcription factor AP-1 transcription factor AP-1 subunit Jun v-jun sarcoma virus 17 oncogene homolog Transcription factor Jun Activator protein 1 Proto-oncogene c-Jun Transcription factor AP-1 subunit Jun V-jun avian sarcoma virus 17 oncogene homolog
Location (GRCh38)
1:58776845-58784048 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_002228.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_002228.4
Sequence length
3257 nt
GC Content
0.5613

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1243 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1299.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 825.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_002228.4 GCUCAGAGUUGCACUGAGUGUGGCUGAAGCAGCGAGGCGGGAGUGGAGG… 3257 nt 0.5613
Summary

This gene is the putative transforming gene of avian sarcoma virus 17. It encodes a protein which is highly similar to the viral protein, and which interacts directly with specific target DNA sequences to regulate gene expression. This gene is intronless and is mapped to 1p32-p31, a chromosomal region involved in both translocations and deletions in human malignancies. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image