Basic Information

Symbol
KCMF1
RNA Class
mRNA
Alias
potassium channel modulatory factor 1 DEBT91 PCMF DKFZP434L1021 ZZZ1 FIGC E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1 FGF-induced in gastric cancer FGF-induced ubiquitin-protein ligase in gastric cancers RING-type E3 ubiquitin transferase KCMF1 ZZ-type zinc finger-containing protein 1 differentially expressed in branching tubulogenesis 91 zinc finger, ZZ domain containing 1 Potassium channel modulatory factor EC 2.3.2.27 EC 6.3.2
Location (GRCh38)
2:84970644-85059472 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_020122.5
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_020122.5
Sequence length
7500 nt
GC Content
0.4255

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2182 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2325.92 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1659.27
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_020122.5 AGGCCCGAGAGUGACCGGAGUCACGGCGGGCGCCGGCGGAGCUGCGGCG… 7500 nt 0.4255
Summary

Enables ubiquitin protein ligase activity. Involved in several processes, including negative regulation of HRI-mediated signaling; proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; and protein polyubiquitination. Located in cytosol. Is active in cytoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Nov 2024]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
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