Basic Information

Symbol
KCNH1
RNA Class
mRNA
Alias
potassium voltage-gated channel subfamily H member 1 Kv10.1 eag h-eag eag1 hEAG K(V)10.1 ether-a-go-go 1 potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 1 TMBTS ZLS1 hEAG1 voltage-gated delayed rectifier potassium channel KCNH1 EAG channel 1 ether-a-go-go potassium channel 1 ether-a-go-go, Drosophila, homolog of potassium channel, voltage gated eag related subfamily H, member 1 voltage-gated potassium channel subunit Kv10.1 EAG EAG1 Voltage-gated delayed rectifier potassium channel KCNH1 Ether-a-go-go potassium channel 1 Potassium voltage-gated channel subfamily H member 1 Voltage-gated potassium channel subunit Kv10.1
Location (GRCh38)
1:210676823-211134183 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_002238.4
BLAST PRIMER
NM_172362.3
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_172362.3
Sequence length
8140 nt
GC Content
0.4979

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2794.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2942.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1915.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_002238.4 GCACUGCGAGGCGGGCCGCAGGGAGGGAGGCGCGAAGAGGGCGCGAGGG… 8059 nt 0.4978
NM_172362.3 GCACUGCGAGGCGGGCCGCAGGGAGGGAGGCGCGAAGAGGGCGCGAGGG… 8140 nt 0.4979
Summary

Voltage-gated potassium (Kv) channels represent the most complex class of voltage-gated ion channels from both functional and structural standpoints. Their diverse functions include regulating neurotransmitter release, heart rate, insulin secretion, neuronal excitability, epithelial electrolyte transport, smooth muscle contraction, and cell volume. This gene encodes a member of the potassium channel, voltage-gated, subfamily H. This member is a pore-forming (alpha) subunit of a voltage-gated non-inactivating delayed rectifier potassium channel. It is activated at the onset of myoblast differentiation. The gene is highly expressed in brain and in myoblasts. Overexpression of the gene may confer a growth advantage to cancer cells and favor tumor cell proliferation. Alternative splicing of this gene results in two transcript variants encoding distinct isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image