Basic Information

Symbol
KLHL1
RNA Class
mRNA
Alias
kelch like family member 1 KIAA1490 MRP2 FLJ30047 Kelch-like protein 1 Mayven-related protein 2 kelch (Drosophila)-like 1 kelch-like 1 (Drosophila)

Secondary Structure

MANE Select
NM_020866.3
Sequence length
4105 nt
GC Content
0.4580

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1280.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1357.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 877.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((((((..........))))))))))((((((........(((.........).))(((((((((....................((((((((((....(((((.(((((((.(((.(((((((....).))))))))).))).((((((((....((.((((((.((((((..(((((((..(((((((((((.((.......(.((((.((..(((((.(((((.....(((..((((((((((..(((.(((((((...(((........))))))).))).))).))))..))).)))((((.......)))).))).....))))).))))).)).)))).)...)).)))).)))((((((((....)))))).))...((((((((((((((((((((...(((((....)))))((((((((..((((.(((((((((.(.((.(.((((...(((((...((((((.((((.(((((((....((....))....((((((..(((....)))..)))))).))).))))))))....))))))...(((((.((((((((...(((..........))).))))))))))))).((((.(((((.(((....))).))))))).))(((((.((.....)))))))))))).)))))))))))))).)))((((((.((((((..((((((((.((.((.....(((((((.(((((((((((....((((.....))))....((((.((((((((.....)))((((((...))))))..(((((((.(((((....(((((((((((....((((((((.((((....)))).))))))))((((((((...)))).)))).))))).(((...)))..)))))).)))))..)))))))..)))))..)))).((((.((((.((.(.(((..((((......))))..)))).)).))))))))((((((((((..((((((((((..(((.(.(((((((..((..((..((((.(((((((....((.(((....))).))))).))))..((((((....(((........)))..))))))((((((((((.(((....)))))))))).)))(((((.(((((.(......).)))))))))).......((((((((((((((...........))))))))))....)))).))))..))...))))))))).).)))....(((((........))))).(((((...(((......)))..))))).(((((((((.(((..((((((...((((((.((((((...(((((......)))))...))))))..(((......))).((((...((((.....(((.(((........))))))..))))....)))).....))))))....)))))).((((((.....(((((((((....((((((((.....)))))))))))..))))))))))))......(((.(((((........))))).))).((((...))))............)))))))).)))).....))))))))...........(((((((.(((((((((..(((((((((((.......((((((((.((((((((((((((..((((..(((((.(((((((......((((..(((........)))..))))........)))))))..))))).)))))))))))....))).))))...(((..((((..(((..(((((((....(((..(((((...((((((......))))))......)))))..)))....))))))).))))))))))....(((((.....)))))((((((((.((..(((..((((....))))..)))..)).))))).))).....((((.((.(((((......)))))..))...)))))))))))).......)))))).(((((..((((.((..(((((.(((....))).)))))......)))))))))))..((((((..........)))))).....))))).))....(((((((((((((........................)))).)))))))))))))))).))))).))...........(((.(((((.((.((((.........))))))........))))).))).))..))))))))))..)))))))))))))))))))).))))))((((((..((((...((((........)))))))).)))))).....((((((.(((...))).))))))..............((((((.....)))))).......(((((........)))))))))))))))..((((((..((((.......)))))))))))))))).((.((((((....))))))))......))))..))))))))......(((....((((.((((((((....))).))))).)))))))((((((((((((......))))..((((((........))))))((..(((((((((((....(((((...(((....))).)))))))))))).))))..))................)))))))).))))))..)))).))))))).)))..((((((((((.((((............((.((((((((.........)))))))).))..)))))))....)))))))(((((((((......)))))))))...........))))..))....)))))..)))))).)))))).))....))))))))(((((((........)))))))..(((((((((.((.......)).))))).)))).(((((......((((.((..((..((((..........))))...))...)).)))).......))))))))).)))))....))).)))))))(((((....)))))......)))))))))((((((.((.(((((.((.(((((((..((((((((............))))))))..)).))))).))))))).)).))))))...((((((...(((((.(((..((((((((.........)))))))).....(((((.((((.(..((((((....................((((((((...(((((((((((.....(((((((((.((((.(((((((((((((((((((......)))))).)))..)))))))))).))))......))))))))).....(((((((((((((((..(((((.((((((....))))))..)))))............((((.((.(((.(((((((.((...)).)))))))))).)).))))((((.((((((....)).)))))))))))))))).(((((((((((((....(((..(((((.((((((((((((....((.................))))))))......)))))..).)))))..))))))))))))))))...(((((.(((((.(..(((((((((.............................((((((....))))))(((((((..........)))))))...((((((((.....((.....))....)))))))).(((((((.(((.(((...(((((............(((((((((..((.((((((((....)))))(((....))).))).))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))..).)))))......))))).....))))))).....((((((....)))))).......((((....)))))))))))).((((......))))(.(..(((((...(((((........)))))...)))))..).)...)))))))))))...)))))).))))).))))).............((((.(((((...........)))))..)))).))).)))))....)))))).......)))))).((((((((((.((((...........))))...))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{.((((((((.,.......}))))))))}}((((({.{({(..{((..........)}}..||||.{(({{{,...{{{{{{{{{,..,{({(((((({....({{({.{{,((((.(((.(((((({....}.))))))))).)))}((((((((....((.((((((.((((((..(((((((..(((((((((((.((,,,,...,.{(((.((..(((((.(((({...,|{{,..((((((((((,.(((.(((((((..,(({........)}})))).))).))).))))..))).))},{{|........,|||,,,},,..})))).))))).)).)))),)...)).)))).)))((((((({....}))))).)),{.((((((((((((((((((((...(((((....)))))((((((((..((((.((((((((({{.{(.(.((((...(((((...((((((.{(((.(((((((.{,{({....||....||{{{{.{(((,...})),})))))}.))).)))))))}....))))))...{{((((({{{||||,..((({,,..{{,..,}}.,)))})))))))}.((((.(((((.(((....))).))))))).))((((((((.....)))))))))))).)))))))))))))).)))((((((.((((({..((((((((.((.((.....(((((({{(((((((((((...,((((.....)))),...((((.((((((,......}}|{{{{({..,))))}}..(((((((.(((((....((({{{(((((..,,((((((((.((((....)))).))))))))||((((((...)))).)))).))))).(((...}))..})))}}.)))))..))))))).,)))))..)))).((((.((((.((.{.{{{,.|{{{|,,,,||}}}.}))}).)).)))))))|((((((((((..((((((((((..(((.(.(((((((.,({{.((..((((.(((((({.,{{(,.(((.,..}||.},}))..}))}},{||||||,}||{.....,.,|||,|||,}},{(((((((((.(((....)))))))))))}}}(((((.(((((.(......}.))))))))))........{|||||||{||||..,.,,,,...}}})))))||....,))}.))))..)).}.))))))))).).)))....(((((........))))).{((((,.,({{......))},,))))}.(((((((((.(((..({{{{{...{{((((.((((((...(((({......}))))...)))))).}}}}...|||||{{({(({{,{{{({{{.,{{{.(((,,....||}}}},}},},}},...}}}),,,,}))})))}},,)})))).((((((.....(((((((((....((((((({.....)))))))))))..)))))))))))),....{(((.(((({.{..,,|,}}}},.}})}||{{...))))...,,,......))))))))}}))).....))))))))....,{{....(((((((.((((((({{,.,((((((((((,,,,,..{{{||||||((((((((((((((..((((..(((((.(((((((...,,.((((..(((........)))..)))).},.....)))))))..))))).)))))))))))...,))).)))}.{((.....}}}.,((({,(({.((({.......((((,...}}}}|||....))))}})),}}}},....,.,{{{,.{,|||||,|,{{{{{{{|,..{,.(((((.....)))))||{||||||||..((({{((((.,,,|}}|.,|||..|}.,}))),.}}...,,,|||}{{.{(((|......)))))..))||.|}}))}}}}}}).,....,)))))}.{{|||..,{{{|||.,,,,,...,,,}},|||{|{|,|||,...,,)))))))))}.|||{||,.....,,)}.))))),,,,|||,,,..},,,.(((((((((((((........................)))),,))))))))))))))).))))).)).,..},.....(({.(((({.,,.{{{{.......,,|}||||......}}))))).))).))..)))))))))),.)))))))))))))))))))).))))))((((((..((((...((((........)))))))).)))))).....((((((.(((...))).))))))..............((((((.....))))))....,,.(((((........)))))))))})))))..((((((..{(((.......)))})))))))))))).{{.((((((....))))))}}......))))..))))))))......(((....{(({.((((((((....))).))))).}))))))(((((((({{((......}})),{((((({.{,...,}))))))||..(((((((((((,...{((((...{{{....))}.)))))))))))).))))..}|......,},...},..)))))))).))))))..)))).))))))).))).}(((((((....{.(({{({........((.((((((((.........)))))))).)),,..)))))}.,.)))))))(((((((((......)))))))))...........))))..))....)))))..)))))).)))))).))....))))))))(((((((........)))))))..{{{{{{{{{.({.|.,,,.}},))))),)}},.{,{((,.,{{,((((,((,.{{..((((..........)))).,,||...}|,||||,......,,))))))),}}))}.,}})))}}}}||||{((((....})))}.....,||}.,,,,.((((((.((.(((((.({.(((((((..((((((((.{,,...,,,..))))))))..))}})))),},))))).)).))))))...,}}|||,|||||||.|||.,||||{|,||||||}}}}}..,}}}}}),..|||{,.||||}}}.|||{{{...................,((((((((...(((((((((((.....(((((((((.((((.(((((((((((((((((((......)))))).)))..)))))))))).))))......}))))))))..,,.(((((((((((((((..(((((.((((((....))))))..)))))............{(({.((.(((.(((((((.((...)).)))))))))).)).}))}((({,{{{{{{....)}.}}}})))))))))))).(((((((((((((....(((..(((((.{(((((((((((....({.................)}))))))......))))}..}.)))))..))))))))))))))))...(((((.(((((.,..(((((((((...,..,.|{.,,..........,.....((((((....))))))(((((((,{.....,}.)))))))...{(((((((.....{(.....}}....)))))))).(((((({{(((.(((...{((((............((((((((({{(,.{{{((({{....}}}}}(((....))),,}}.))}.))))))))))))))))))))))))))))))))))))..}.))))}...,..))))).....))))))).,|,.{(((((....}))))}.......{(((....)))})))))))).((((......)))){.(..(((((...(((((........)))))...)))))..).}...)))))))))))...}}}))),}},}).)))))....,,,.,{{{{,,(({(,,,({(({,,{{{{..,||,..}),,}}}}|}}}}}..)))).)}}},..,,.)))))).{(((((((((........,,....,.)}.....)))))))))}

Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001286725.2 GUACUGUGAGGACCUUGACAGCUUCACAGGCGGGCUUUUUCUUUUGCCU… 3922 nt 0.4595
NM_020866.3 GUACUGUGAGGACCUUGACAGCUUCACAGGCGGGCUUUUUCUUUUGCCU… 4105 nt 0.4580
Summary

The KLHL1 protein belongs to a family of actin-organizing proteins related to Drosophila Kelch (Nemes et al., 2000 [PubMed 10888605]).[supplied by OMIM, Feb 2010]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image