Basic Information

Symbol
KLK2
RNA Class
mRNA
Alias
kallikrein related peptidase 2 kallikrein 2, prostatic KLK2A2 hGK-1 hK2 kallikrein-2 glandular kallikrein 2 glandular kallikrein-1 tissue kallikrein-2 Kallikrein-2 Glandular kallikrein-1 Tissue kallikrein-2 EC 3.4.21.35 EC 3.4.21
Location (GRCh38)
19:50861568-50880567 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001002231.3
BLAST PRIMER
NM_001002232.2
BLAST PRIMER
NM_001256080.2
BLAST PRIMER
NM_005551.5
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_005551.5
Sequence length
2829 nt
GC Content
0.5111

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1029 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1075.69 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 803.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001002231.3 AAACUCACCACCUGGCCGUGGACACCUGUGUCAGCAUGUGGGACCUGGU… 2866 nt 0.5115
NM_001002232.2 CCCAAACUCACCACCUGGCCGUGGACACCUGUGUCAGCAUGUGGGACCU… 2856 nt 0.5112
NM_001256080.2 AAACUCACCACCUGGCCGUGGACACCUGUGUCAGCAUGUGGGACCUGGU… 2669 nt 0.5054
NM_005551.5 AAACUCACCACCUGGCCGUGGACACCUGUGUCAGCAUGUGGGACCUGGU… 2829 nt 0.5111
Summary

This gene encodes a member of the grandular kallikrein protein family. Kallikreins are a subgroup of serine proteases that are clustered on chromosome 19. Members of this family are involved in a diverse array of biological functions. The protein encoded by this gene is a highly active trypsin-like serine protease that selectively cleaves at arginine residues. This protein is primarily expressed in prostatic tissue and is responsible for cleaving pro-prostate-specific antigen into its enzymatically active form. This gene is highly expressed in prostate tumor cells and may be a prognostic maker for prostate cancer risk. Alternate splicing results in both coding and non-coding transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2012]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image