Basic Information
Symbol
KRT13
RNA Class
mRNA
Alias
keratin 13
K13
CK13
MGC3781
MGC161462
keratin, type I cytoskeletal 13
cytokeratin 13
keratin 13, type I
WSN2
CK-13
Keratin, type I cytoskeletal 13
Cytokeratin-13
Keratin-13
Location (GRCh38)
17:41500981-41505705
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_153490.3
Sequence length
1714 nt
GC Content
0.5823
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-702.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-733.29 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
323.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_002274.4 | ACAGUCCUCGGCCCAGGCCAAGCAAGCUUCUAUCUGCACCUGCUCUCAA… | 1688 nt | 0.5835 |
| NM_153490.3 | ACAGUCCUCGGCCCAGGCCAAGCAAGCUUCUAUCUGCACCUGCUCUCAA… | 1714 nt | 0.5823 |
Summary
The protein encoded by this gene is a member of the keratin gene family. The keratins are intermediate filament proteins responsible for the structural integrity of epithelial cells and are subdivided into cytokeratins and hair keratins. Most of the type I cytokeratins consist of acidic proteins which are arranged in pairs of heterotypic keratin chains. This type I cytokeratin is paired with keratin 4 and expressed in the suprabasal layers of non-cornified stratified epithelia. Mutations in this gene and keratin 4 have been associated with the autosomal dominant disorder White Sponge Nevus. The type I cytokeratins are clustered in a region of chromosome 17q21.2. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants; however, not all variants have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
