Basic Information
Symbol
KRT19
RNA Class
mRNA
Alias
keratin 19
K19
CK19
K1CS
MGC15366
keratin, type I cytoskeletal 19
keratin, type I, 40-kd
cytokeratin 19
40-kDa keratin intermediate filament
keratin 19, type I
CK-19
Keratin, type I cytoskeletal 19
Cytokeratin-19
Keratin-19
Location (GRCh38)
17:41523613-41528308
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_002276.5
Sequence length
1390 nt
GC Content
0.6180
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-592.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-611.69 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
306.44
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_002276.5 | GCUCCUCCCGCGAAUCGCAGCUUCUGAGACCAGGGUUGCUCCGUCCGUG… | 1390 nt | 0.6180 |
Summary
The protein encoded by this gene is a member of the keratin family. The keratins are intermediate filament proteins responsible for the structural integrity of epithelial cells and are subdivided into cytokeratins and hair keratins. The type I cytokeratins consist of acidic proteins which are arranged in pairs of heterotypic keratin chains. Unlike its related family members, this smallest known acidic cytokeratin is not paired with a basic cytokeratin in epithelial cells. It is specifically expressed in the periderm, the transiently superficial layer that envelopes the developing epidermis. The type I cytokeratins are clustered in a region of chromosome 17q12-q21. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
