Basic Information

Symbol
KRT4
RNA Class
mRNA
Alias
keratin 4 CK4 K4 cytokeratin 4 keratin, type II cytoskeletal 4 CYK4 CK-4 WSN1 keratin 4, type II type-II keratin Kb4 Keratin, type II cytoskeletal 4 Cytokeratin-4 Keratin-4 Type-II keratin Kb4
Location (GRCh38)
12:52806549-52814116 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_002272.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_002272.4
Sequence length
2141 nt
GC Content
0.5525

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-791.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -828.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 493.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_002272.4 ACUCACCGGCCUGGGCCCUGUCACUUCUCUGAUAGCUCCCAGCUCGCUC… 2141 nt 0.5525
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the keratin gene family. The type II cytokeratins consist of basic or neutral proteins which are arranged in pairs of heterotypic keratin chains coexpressed during differentiation of simple and stratified epithelial tissues. This type II cytokeratin is specifically expressed in differentiated layers of the mucosal and esophageal epithelia with family member KRT13. Mutations in these genes have been associated with White Sponge Nevus, characterized by oral, esophageal, and anal leukoplakia. The type II cytokeratins are clustered in a region of chromosome 12q12-q13. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image