Basic Information

Symbol
KRT9
RNA Class
mRNA
Alias
keratin 9 EPPK K9 CK-9 cytokeratin 9 type I cytoskeletal 9 epidermolytic palmoplantar keratoderma keratin 9, type I EPPK1 keratin, type I cytoskeletal 9 Keratin, type I cytoskeletal 9 Cytokeratin-9 Keratin-9
Location (GRCh38)
17:41565836-41572059 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_000226.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_000226.4
Sequence length
2296 nt
GC Content
0.5483

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-857.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -898.2 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 625.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_000226.4 ACCCUGCACUUGGGAGCCGGUAGCACUCCUAUCACUGCUUCUCAACCCG… 2296 nt 0.5483
Summary

This gene encodes the type I keratin 9, an intermediate filament chain expressed only in the terminally differentiated epidermis of palms and soles. Mutations in this gene cause epidermolytic palmoplantar keratoderma. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image