Basic Information

Symbol
LAMB3
RNA Class
mRNA
Alias
laminin subunit beta 3 nicein-125kDa kalinin-140kDa BM600-125kDa laminin, beta 3 (nicein (125kD), kalinin (140kD), BM600 (125kD)) laminin, beta 3 AI1A JEB1A JEB1B LAM5 LAMNB1 laminin subunit beta-3 epiligrin subunit bata kalinin B1 chain kalinin subunit beta laminin B1k chain laminin S B3 chain laminin beta 3 laminin-5 subunit beta nicein subunit beta Laminin subunit beta-3 Epiligrin subunit bata Kalinin B1 chain Kalinin subunit beta Laminin B1k chain Laminin-5 subunit beta Nicein subunit beta
Location (GRCh38)
1:209614870-209653106 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_000228.3
BLAST PRIMER
NM_001017402.2
BLAST PRIMER
NM_001127641.1
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_000228.3
Sequence length
4014 nt
GC Content
0.5949

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1645.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1716.2 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1048.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_000228.3 ACAUUCAAGAGGAGCUUUCAGGCGAUCUGGAGAAAGAACGGCAGAACAC… 4014 nt 0.5949
NM_001017402.2 CUCUCUUGGGGCUGGAACUAGGUCUUGGCCCUUUCUACAGCUUUUCUCC… 4350 nt 0.5883
NM_001127641.1 GCGGGAGGAGGACUGUAUCUCUGGAUGCCUGGGGCCUGGUUUCAGGGCC… 4067 nt 0.5918
Summary

The product encoded by this gene is a laminin that belongs to a family of basement membrane proteins. This protein is a beta subunit laminin, which together with an alpha and a gamma subunit, forms laminin-5. Mutations in this gene cause epidermolysis bullosa junctional Herlitz type, and generalized atrophic benign epidermolysis bullosa, diseases that are characterized by blistering of the skin. Multiple alternatively spliced transcript variants that encode the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image