Basic Information

Symbol
ANKRD12
RNA Class
mRNA
Alias
ankyrin repeat domain 12 KIAA0874 FLJ20053 GAC-1 ANCO-2 ankyrin repeats containing cofactor 2 ANCO1 Nbla00144 ankyrin repeat domain-containing protein 12 ankyrin repeat-containing cofactor 2 ANCO2 Ankyrin repeat domain-containing protein 12 Ankyrin repeat-containing cofactor 2 GAC-1 protein
Location (GRCh38)
18:9136228-9285985 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001083625.3
BLAST PRIMER
NM_001204056.1
BLAST PRIMER
NM_015208.5
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_015208.5
Sequence length
11284 nt
GC Content
0.3557

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2583.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2808.17 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3007.1
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
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NM_001204056.1 CGGCCGCUCGGGCCGGGAGCGUCGGAGGUACCCGGGUCCUGGGAGAGGU… 11358 nt 0.3538
NM_015208.5 GCGGGGCGACGCUGUCCUGGGAGCGAGGAGGCUGUGGUGAGAGACGGAC… 11284 nt 0.3557
Summary

This gene encodes a member of the ankyrin repeats-containing cofactor family. These proteins may inhibit the transcriptional activity of nuclear receptors through the recruitment of histone deacetylases. The encoded protein interacts with p160 coactivators and also represses transcription mediated by the coactivator alteration/deficiency in activation 3 (ADA3). Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2011]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
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