Basic Information

Symbol
LCOR
RNA Class
mRNA
Alias
ligand dependent nuclear receptor corepressor MLR2 FLJ38026 KIAA1795 DKFZP564P1916 FLJ13022 chromosome 10 open reading frame 12 C10orf12 ligand-dependent corepressor mblk1-related protein 2 Ligand-dependent corepressor LCoR Mblk1-related protein 2
Location (GRCh38)
10:96831803-96995956 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001170765.2
BLAST PRIMER
NM_001170766.2
BLAST PRIMER
NM_001346516.2
BLAST PRIMER
NM_015652.3
BLAST PRIMER
NM_032440.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_001346516.2
Sequence length
16001 nt
GC Content
0.4299

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4624.94 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -4938 kcal/mol
Frequency: 2.52e-221
Diversity: 3808.44
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
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NM_001170766.2 AGAAGAUGGCGAGGGUGUGUAGGCGGCAGCAAUGCUCCGUUGAGAGACG… 7744 nt 0.3680
NM_001346516.2 AGAAGAUGGCGAGGGUGUGUAGGCGGCAGCAAUGCUCCGUUGAGAGACG… 16001 nt 0.4299
NM_032440.4 GCUCGGGCGUGUGCGAAGCGUGAGGUGGAGAUGGGGGCGGAGGGAGCUG… 10389 nt 0.3677
Summary

LCOR is a transcriptional corepressor widely expressed in fetal and adult tissues that is recruited to agonist-bound nuclear receptors through a single LxxLL motif, also referred to as a nuclear receptor (NR) box (Fernandes et al., 2003 [PubMed 12535528]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
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